四、酶高效催化的策略 邻近与定向效应 2、 诱导契合与底物扭曲变形 3、 共价催化 4 酸硷催化 5、 微环境影响 实例:yso△wme chymotrypsin carboxypeptidase RNase
四、酶高效催化的策略 1、 邻近与定向效应 2、 诱导契合与底物扭曲变形 3、 共价催化 4、 酸硷催化 5、微环境影响 实例: lysozyme chymotrypsin carboxypeptidase RNase
酶分子中可作为亲核基团和酸硷催化的功能基团 亲核基团亲电子原子 氨基酸种类 酸催化基团(质子供体) 碱催化基团(质子受体】 丝氨酸整基-CH2~骨 Glu.Asp -COOH -00 Lys NH: -NH2 Cys SH 半酰氨酸蔬基-CH?一骨 Tyr OH 一C=CH -C=CH -CH2-C=CH His HN HN 组氨酸咪唑基 H H
酶分子中可作为亲核基团和酸硷催化的功能基团
Glu270 羧肽酶结合底物前后构象变化 Tyr248 Arg145 底物 20A
Zn Zn Glu270 Tyr248 Arg145 底物 羧肽酶结合底物前后构象变化
A.非差 示标记 y 舞底物) 差示标记法图解 B.差示 标记 R R
差示标记法图解 RR R R R* A.非差 示标记 B. 差示 标记 R R R* (底物 ) R
溶菌酶催化的反应 NAG:N-乙酰氨基葡萄糖 NAM:N-乙酰氨基葡萄糖乳酸 NAG NAM NAG NAM CHOH CH,OH CH,OH CH2OH 0 OH OR OR 0 CH,OH CH2OH CH,OH -0 CH C CH NAG NAM NAG NAM Figure 9-4
溶菌酶催化的反应 NAG:N-乙酰氨基葡萄糖 NAM:N-乙酰氨基葡萄糖乳酸