四、与酶的高效率有关的主要因素 邻近与定向效应 2、 诱导契合与底物扭曲变形 3、 共价催化 4、 酸硷催化 5、微环境影响 实例:胰凝乳蛋白酶 chymotrypsin
四、与酶的高效率有关的主要因素 1、 邻近与定向效应 2、 诱导契合与底物扭曲变形 3、 共价催化 4、 酸硷催化 5、微环境影响 实例: 胰凝乳蛋白酶 ( chymotrypsin)
酶分子中可作为亲核基团和酸硷催化的功能基团 亲核基团亲电子原子 氨基酸种类 酸催化基团(质子供体) 碱催化基团(质子受体) 丝氯酸经基-GH2-日 Glu.Asp -COOH -C00 Lys NH: NH, Cys SH -S 半能氨酸蔬莲-G:一 Tyr OH -0 -C=CH -CH2-C=CH 一C=CH His HN HN N 组氨酸咪唑基 H H H
酶分子中可作为亲核基团和酸硷催化的功能基团
0 102Asp-C-0-H-N N-H-0-Ser195 HC=C 4p102 His57 A.酶分子中的电荷中继网 Ser195 102Asp-0-H- N一H O-Ser195 HC- His57 底物 His57 Asp102 B.加上底物后,从Ser转移一个质子给His, 带正电荷的咪唑基通过带负电荷的Asp静电 宰耀鐾名氯 相互作用被稳定
胰凝乳蛋白酶分子 中催化三联体构象 His57 Asp102 Ser195 His57 Asp102 Ser195 His57 102Asp Ser195 A.酶分子中的电荷中继网 B.加上底物后,从Ser转移一个质子给His, 带正电荷的咪唑基通过带负电荷的Asp静电 相互作用被稳定 102Asp Ser195 His57 底物
胰凝乳蛋白酶反应的详细机制 (1) R HN p底物 R NH O-HN 结合底物 195 Ser Asp102 Ser 195 形成共价 ES复合物 R His57 质子供体 NH 95 Ser Asp 102 His57 Asp 102 His57 C-N键断裂
胰凝乳蛋白酶反应的详细机制(1) 结合底物 His57 质子供体 形成共价 ES复合物 C-N键断裂 底物
胰凝乳蛋白酶反应的详细机制 (2) NH 羰基产物释放 Ser 195 R Ser A8p102 His) His 57 水亲核攻击 四面体中间物 o 的瓦解 Asp 102 His $7 His57 羧基产物释放 Asp 102 His57 Ser195
胰凝乳蛋白酶反应的详细机制(2) 羰基产物释放 四面体中间物 的瓦解 水亲核攻击 羧基产物释放