工,24 2o.5 23.5° Peptide bon ⊥22° nexN力B.s° ⊥工9.5 Amide H trans-Peptide Group Figure 7-1. The trans-peptide group I Amide plan∈ L8 ⊥2G 32 王工9° 3 工23°121° Peptide bond cis-Pepti Figure了 The cis-peptide group Copyroto 100o Jorn wiay Sons vooa'Bochemsl 17
面角 neara angle a.单键的旋转角度 Ca-C: p(psi) Ca-N: ((phi) cArbon b.二面角决定了两个相邻肽 平面的空间相对位置 Anide plane 4180,y
◼ 二面角 （dihedral angle） a. 单键的旋转角度 Cα-C:Ψ（psi） Cα-N:Φ（phi） b.二面角决定了两个相邻肽 平面的空间相对位置
肽平面一构成蛋白质二级结构的基本单位 Nonbonded 求 Nonbonded 0 0,=180° A further rotation of 12 moves the bulky carbo 0v-18° u180°v=0° group a far a poe °v Erom the ode chain
肽平面— 构成蛋白质二级结构的基本单位
α-螺腚(α- helix) 结抱特征:以3.6螺旋为例 N-terminal Hydrogen To N bonds terminal hold helix coIls To C- in shape termina C-terminal ● Carbon atom● Oxygen aton● Nitrogen ato □ Hydrogen atom● R group
α-螺旋（α-helix） 结构特征：以3.613螺旋为例
a.36掐绚圈螺施36个残基 b.13表示氢封闭的环内含13个原子 氢键在第一个肽键的亚氨基NH的H原子与其 前方四个肽键的羰基C=O的原子之间形成) rr…"H H C-c 3 R
a. 3.6 指每圈螺旋含 3.613螺旋 3.6个残基 b. 13表示氢键封闭的环内含13个原子 (氢键在第一个肽键的亚氨基-NH的H原子与其 前方第四个肽键的羰基C=O的O原子之间形成 ) C Cα R N O H H N H C O n=3