Val、Ile、Leu 带有分支的支链氨基酸，产生的位阻也更大； >易于在蛋白质分子中固定于一定位置，并有利于链 的折叠 C00 C00 HN-C-H C00 HyN-C-H H-C-CH3 H:N-C-H CH2 CH2 CH CH CHs CH3 CH3 CHs CHa Valine Isoleucine Leucine 缬氨酸 亮氨酸 异亮氨酸
Val、 Ile、 Leu ¾ 带有分支的支链氨基酸，产生的位阻也更大； ¾ 易于在蛋白质分子中固定于一定位置，并有利于链 的折叠 缬氨酸 亮氨酸 异亮氨酸
Pro >一种亚氨酸，具有固定的构型 >氨基与侧链C原子成环，很强的立体化学效应 >使肽链形成一个转角而改变主链方向 COO H >对二级结构有破坏作用，但仍能出现在 这些结构末端或弯曲部位 H2C CH2 >常暴露于蛋白质分子表面 Proline 脯氨酸
Pro ¾ 一种亚氨酸,具有固定的构型 ¾ α氨基与侧链C原子成环，很强的立体化学效应 ¾ 使肽链形成一个转角而改变主链方向 ¾ 对二级结构有破坏作用，但仍能出现在 这些结构末端或弯曲部位 ¾ 常暴露于蛋白质分子表面 脯氨酸
2.芳香族氨基酸 苯丙氨酸(Phe,F) 酪氨酸 (Tyr,Y) 色氨酸 (Trp,W)
2. 芳香族氨基酸 苯丙氨酸（Phe, F） 酪氨酸 （Tyr, Y） 色氨酸 （Trp, W）
Phe、Tyr、Trp >Phe疏水作用很强；而Tyr、Trp带极性侧链，疏水性较差； Tyr酚基易解离，易形成较强的氢键，故常出现在分子内。 >三种氨基酸C,与芳环之间仅有一个可转动的C。甲烯基，从而 限制了侧链的柔性，Tp有大的哚环，影响更大。 >1 侧链环堆积不规则，常以相互垂直的“人”字型排列，其存在 形式对周围结构有很大影响。 ● H3N HaN 五2 OH Phenylalanine Tyrosine Tryptophan 苯丙氨酸 酪氨酸 色氨酸
Phe、Tyr、Trp ¾Phe 疏水作用很强; 而 Tyr、Trp 带极性侧链，疏水性较差； Tyr 酚基易解离，易形成较强的氢键，故常出现在分子内。 ¾三种氨基酸Cα与芳环之间仅有一个可转动的 Cβ 甲烯基，从而 限制了侧链的柔性， Trp有大的吲哚环，影响更大。 ¾侧链环堆积不规则，常以相互垂直的“人”字型排列，其存在 形式对周围结构有很大影响。 苯丙氨酸 酪氨酸 色氨酸
3.羟基氨基酸与含硫氨基酸 丝氨酸 (Ser,S) 半胱氨酸 (Cys,C) 苏氨酸 (Thr,T) 甲硫氨酸 (Met,M)
3. 羟基氨基酸与含硫氨基酸 丝氨酸 （Ser, S） 半胱氨酸 （Cys, C） 苏氨酸 （Thr, T） 甲硫氨酸 （Met, M）