二、从头开始的基因预测 从基因组测序一开始，一个明确的目标就是能够准 确地进行从头开始（ab initio)的基因预测，即只依 赖蕴含在DNA序列内部的信息来确定基因结构。 从头开始的基因预测包括两个主要步骤，即蛋白质 编码基因特征的识别和基因结构的生成。 从头预测基因软件：GENSCAN
二、从头开始的基因预测 从基因组测序一开始，一个明确的目标就是能够准 确地进行从头开始（ab initio）的基因预测，即只依 赖蕴含在DNA序列内部的信息来确定基因结构。 从头开始的基因预测包括两个主要步骤，即蛋白质 编码基因特征的识别和基因结构的生成。 从头预测基因软件：GENSCAN
The GENSCAN Web Server at MIT Identification of complete gene structures in genomic DNA n上onn士1 on about Gonoon,olick here Server update,November,2009:We've been recently upgrading the GENSCAN webserver hardmare,which resulted in some problems in the output of GENSCAN.We apologize for the inconvenience.These output errors were resolved. This server provides access to the program Genscan for predicting the locations and exon-intron structures of genes in genomic sequences from a variety of organisms. This server can accept sequences up to 1 million base pairs (1 Mbp)in length.If you have trouble with the web server or if you have a large number of sequences to process,request a local copy of the program (see instructions at the bottom of this page). Organism: Vertebrate Suboptimal exon cutoff (optional): 1.00 Sequence name (optional): Print options: Predicted peptides only Upload your DNA sequence file (upper or lower case,spaces/numbers ignored): 选择文件未选择文件 Or paste your DNA sequence here (upper or lower case,spaces/numbers ignored): Run GENSCAN Clear Input
三、重新基因预测 重新预测软件：Twinscan、SGP2、SLAM 四、整合信息 (一)人工整合 (二)自动整合
三、重新基因预测 重新预测软件：Twinscan、SGP2、SLAM 四、整合信息 （一）人工整合 （二）自动整合
五、蛋白质编码基因的功能注释 常用的数据库主要包括NCBI的NT、NR(非荣冗余蛋 白质序列数据库)、UniProt、InterPro、KEGG、 KOG等
五、蛋白质编码基因的功能注释 常用的数据库主要包括NCBI的NT、NR（非荣冗余蛋 白质序列数据库）、UniProt、InterPro、KEGG、 KOG等
第二节RNA基因的注释 RNA基因是指不编码蛋白质的基因，又称为非编码 基因(non-coding gene,ncRNA),其编码产物为 一条功能RNA分子。 RNA World mRNA rRNA snoRNA scaRNA tRNA Coding snRNA RNA Non- lincRNA Coding rasiRNA anti- sense RNAi piRNA miRNA stRNA siRNA
第二节 RNA基因的注释 RNA基因是指不编码蛋白质的基因，又称为非编码 基因（non-coding gene，ncRNA），其编码产物为 一条功能RNA分子