生物信息学 普通高等教育 “十二五”规划教材 生物信息学 Bioinformatics 第十一章：生物信息学编程基础
第十一章：生物信息学编程基础 普通高等教育 “十二五”规划教材 生物信息学 Bioinformatics
第一节Linux操作系统 一、Linuxi简介 二、Linux常用命令行操作 表11-1 Linux与DOS常用命令比较 Linux命令符 DOS命令符 功能 ls dir 显示文件及目录 ed ed 改变当前目录 mkdir md 新建目录 rmdir rd 删除目录 m del 删除文件 移动文件 复制文件 less type 阅读文件 echo echo 输出字符串
第一节 Linux操作系统 一、Linux简介 二、Linux常用命令行操作
第二节生物信息学中的编程语言 一、Perl 1、Perl简介 The Perl Programming Language www.perl.org HOME LEARN DOCUMENTATION CPAN COMMUNITY GET INVOLVED DOWNLOAD ABOUT PERL Current Perl version Flexible Powerful 5.18.1-download now That's why we love Perl 5 Find out more Learn Get started DOWNLOAD PERL Documentation Community Events Perl 5 is a highly capable,feature-rich programming language with over 25 years of development.More about why we love Perl... Database interfaces Learning Perl 5 The Perl Community DBIx:ass☒provides With free online books,over 25,000 Perl has an active world wide an Object Relational extension modules,and a large community with over 300 local Mapper (ORM)to developer community,there are groups,mailing lists and databases (e.g.Oracle, many ways to leam Perl 5. support/discussion websites SQL Server,MySQL, Postgress,Access etc) Documentation Contribute to Perl Sponsor Core documentation,FAQs and Perl is being actively developed. translations. There are many ways to get involved. phyber
第二节 生物信息学中的编程语言 一、Perl 1、Perl简介
2、Perl基础 数据类型： 字符串($string)、数组(@aray)、哈希表(%hash) 正则表达式 m//; 子程序 Sub SUBNAME { code; }
2、Perl基础 数据类型： 字符串($string)、数组(@array)、哈希表(%hash) 正则表达式 m//； 子程序 Sub SUBNAME { code; }
包 Package package1; 内置函数 abs、sqrt、exp 文件处理 open(FH,"path../filename"); 模块 LWP::Simple LWP:UserAgent DBI
包 Package package1； 内置函数 abs、sqrt、exp 文件处理 open(FH,”path../filename”); 模块 LWP::Simple LWP::UserAgent DBI