四、结合相关靶DNA的同源域 • 同源（异型）框（homeobox)是一种编码由60 个氨基酸组成的结构域序列。由于最早在果 蝇的同源框基因座（其基因决定身体结构的 特点）中发现而得名。 • 同源（异型）框存在于许多真核生物的DNA 结合蛋白中，负责与DNA结合，与发育调控 有关。在一些动物的转录因子中也发现了与 同源框类似的短序列
四、结合相关靶DNA的同源域 • 同源（异型）框（homeobox)是一种编码由60 个氨基酸组成的结构域序列。由于最早在果 蝇的同源框基因座（其基因决定身体结构的 特点）中发现而得名。 • 同源（异型）框存在于许多真核生物的DNA 结合蛋白中，负责与DNA结合，与发育调控 有关。在一些动物的转录因子中也发现了与 同源框类似的短序列
Drosophila lab pb bcd zen z2 Dfd Scr Antp Ubx adb-A Abd-B H0M-C圆题 hypothetical common ancestor amphioxus Hox cluster 3 10 mouse Hoxa a1 a2 a3 a4 a5 a6 a7 a9a10a11 a13 mouse Hoxb M☑-0□ b1 b2 b3 b4 b5 b6 b7 b8 b9 b13 mouse Hoxc M 愿圆H湿H C4 c5 C6 c8c9c10c11c12c13 mouse Hoxd d1 d3 d4 d8d9d10d11d12d13
Figure 21.11 The homeodomain of the Antennapedia gene represents the major group of genes containing homeoboxes in Drosophila;engrailed(en)represents another type of homeotic gene;and the mammalian factor Oct-2 represents a distantly related group of transcription factors.The homeodomain is conventionally numbered from 1 to 60.It starts with the N-terminal arm,and the three helical regions occupy residues 10-22,28-38,and 42-58. N-terminal arm 10 Helix 1 20 En Glu Lys Arg Pro Arg Thr Ala Phe Ser Ser Glu GIn Leu Ala Arg Leu Lys Arg Glu Phe Asn Glu Antp Arg Lys Arg Gly Arg Gin Thr Tyr Thr Arg Tyr GIn Thr Leu Glu Leu Glu Lys Glu Phe His Phe Oct-2 ArgArg LysLys Arg Thr Ser lle Glu Thr Asn Val Arg Phe Ala Leu Glu Lys Ser Phe Leu Ala 30 Helix2 40 En Asn Arg Tyr Leu Thr Glu ArgArgArg Glu Glu Leu Ser Ser Glu Leu Gly Leu Antp Asn Arg Tyr Leu Thr Arg Arg ArgArg lle Glu lle Ala His Ala Leu Cys Leu 0ct-2 Asn Glu Lys Pro Thr Ser GluGlu lle LeuLeu lle Ala Glu GIn Leu His Met 41 50 Helix 3 60 En Asn Glu Ala GIn lle Lys lle Trp Phe Gin Asn Lys Arg Ala Lys lle Lys Lys Ser Asn Antp Thr Glu Arg GIn lle Lys lle Trp Phe Gin Asn ArgArg Met Lys Trp LysLys Glu Asn Oct-2 Glu Lys Glu Val lle Arg Val Trp Phe Cys Asn ArgArg GIn Lys Glu Lys Arg lle Asn
Figure 21.12 Helix 3 of the homeodomain binds in the major groove of DNA,with helices 1 and 2 lying outside the double helix.Helix 3 contacts both the phosphate backbone and specific bases.The N- terminal arm lies in the minor groove,and makes additional contacts. N-terminal arm lies in minor groove Helices 1 2 lie above the DNA 3 28 Helix 3 lies in the wide groove
八、基因激活的占先模型 • 真核生物细胞的DNA与组蛋白组成核小体结 构，如果启动子区处在核小体内，转录的起 始通常会被抑制。 • 基因激活占先模型模型认为，转录因子与组 蛋白之间在占有DNA上存在竞争，且无论谁 先占领DNA上的位点，都不能被另一方替换
八、基因激活的占先模型 • 真核生物细胞的DNA与组蛋白组成核小体结 构，如果启动子区处在核小体内，转录的起 始通常会被抑制。 • 基因激活占先模型模型认为，转录因子与组 蛋白之间在占有DNA上存在竞争，且无论谁 先占领DNA上的位点，都不能被另一方替换