生物信息学课程生物信息学的历史Bioinformatics北京大学生物信息中心国际人类基因组计划((CBI)成立,EMBnet中、美、日、德、法、HGP)启动。其宗旨在的中国国家节点。当时英等6国科学家和美国于测定组成人类染色体国内数据库种类最多:Celera公司在克雷格·文(指单倍体)中所包含特尔的带领下联合发表数据量最大的生物信息的30亿个碱基对组成的站点,为国内外用户提人类基因组计划"的结果核苷酸序列。供了多项生物信息服务。一人类基因组草图及初步分析。罗静初教授1997199020011998/19991993杨焕明院士1998年,“国家基因组北方研究中心"和由国家自然科学基金委员会生命科学部组“国家基因组南方研究中心"成立。织的以谈家桢教授为组长的专家组·在沪1999年,“北京华大基因研究中心”论证并通过了《中华民族基因组中若干位的成立。我国参加了HGP,并承担了点基因结构的研究》重大项目·标志着我人类3号染色体短臂3000万碱基(约占国HGP正式启动。人类基因组全部碱基序列的1%)的测序任务。国际人类基因组计划15
15 生物信息学 课程 Bioinformatics 1993 由国家自然科学基金委员会生命科学部组 织的以谈家桢教授为组长的专家组,在沪 论证并通过了《中华民族基因组中若干位 点基因结构的研究》重大项目,标志着我 国HGP正式启动。 1990 国际人类基因组计划( HGP)启动。其宗旨在 于测定组成人类染色体 (指单倍体)中所包含 的30亿个碱基对组成的 核苷酸序列。 国际人类基因组计划 北京大学生物信息中心 (CBI)成立,EMBnet 的中国国家节点。当时 国内数据库种类最多, 数据量最大的生物信息 站点,为国内外用户提 供了多项生物信息服务。 1997 1998/1999 1998年,“国家基因组北方研究中心”和 “国家基因组南方研究中心”成立。 1999年,“北京华大基因研究中心” 的成立。我国参加了HGP,并承担了 人类3号染色体短臂3000万碱基(约占 人类基因组全部碱基序列的1%)的测 序任务。 中、美、日、德、法、 英等6国科学家和美国 Celera公司在克雷格·文 特尔的带领下联合发表“ 人类基因组计划”的结果 ——人类基因组草图及 初步分析。 2001 罗静初教授 杨焕明院士 生物信息学的历史
生物信息学课程生物信息学的历史Bioinformatics国家基因组科学数据中心(National由美国、中国和德国等国科学家组成GenomicsDataCenter,简称NGDC)经的合作小组·在《自然》杂志发表人科技部、财政部通知公布,由中国科学院北类3号染色体的DNA完成序列与详尽京基因组研究所(国家生物信息中心)作为分析。这是国际“人类基因组计划"发依托单位·联合中国科学院生物物理研究所表的已完成分析的最大染色体之一。和中国科学院上海营养与健康研究所共同建设。2006201920122003中国科学院北京基因组研究所(现国家生JenniferDoudna和Emmanuelle物信息中心)成立,重点研究基因组结构Charpentier等研究人员揭示CRISPR变异、功能及其演化规律,加强基因组Cas9系统的功能机制。Cas9蛋白可以利学与其他学科的交叉融合,发展基因组学用RNA分子作为引导.识别并切割特定的的新理论、新方法和新技术。DNA序列。这项发现标志着CRISPR技术HGP完成了其主要的测序工作在精确基因编辑方面的互大潜力。16
16 生物信息学 课程 Bioinformatics 由美国、中国和德国等国科学家组成 的合作小组,在《自然》杂志发表人 类3号染色体的DNA完成序列与详尽 分析。这是国际“人类基因组计划”发 表的已完成分析的最大染色体之一。 2003 中国科学院北京基因组研究所(现国家生 物信息中心)成立,重点研究基因组结构 、 变异、功能及其演化规律,加强基因组 学 与其他学科的交叉融合,发展基因组学 的 新理论、新方法和新技术。 HGP完成了其主要的测序工作 2006 2019 国家基因组科学数据中心(National Genomics Data Center,简称NGDC)经 科技部、财政部通知公布,由中国科学院北 京基因组研究所(国家生物信息中心)作为 依托单位,联合中国科学院生物物理研究所 和中国科学院上海营养与健康研究所共同建 设。 2012 Jennifer Doudna和Emmanuelle Charpentier等研究人员揭示CRISPRCas9系统的功能机制。Cas9蛋白可以利 用RNA分子作为引导,识别并切割特定的 DNA序列。这项发现标志着CRISPR技术 在精确基因编辑方面的巨大潜力。 生物信息学的历史
生物信息学课程生物信息学的历史BioinformaticsDeepMind发布了成功利用AlphaFold2AlphaFold3,这是该系列预测98.5%的人类蛋白的最新版本,进一步推进了质组结构。蛋白质结构预测的边界。2020202120222024AlphaFold2在蛋白质结构DeepMind和EMBL-EBI在2022预测大赛CASP14中,对大年7月联合宣布:AphaFold已部分蛋白质结构的预测与真经预测了超过2亿个蛋白质的结实结构只差一个原子的宽度构,覆盖了地球上几乎所有已达到了人类利用冷冻电子知的蛋白质。显微镜等复杂仪器观察预测的水平。美国人工智能研究实验室OpenAl'sNewOpenAl新推出一种人工智能技ChatGPT术驱动的自然语言处理工具一ChatGPT(ChatGenerativePre-trainedTransformer)17
生物信息学 课程 Bioinformatics 2020 AlphaFold 2在蛋白质结构 预测大赛CASP 14中,对大 部分蛋白质结构的预测与真 实结构只差一个原子的宽度 ,达到了人类利用冷冻电子 显微镜等复杂仪器观察预测 的水平。 2021 成功利用AlphaFold 2 预测98.5%的人类蛋白 质组结构。 2022 DeepMind发布了 AlphaFold 3,这是该系列 的最新版本,进一步推进了 蛋白质结构预测的边界。 2024 DeepMind和EMBL-EBI在2022 年7月联合宣布,AlphaFold已 经预测了超过2亿个蛋白质的结 构,覆盖了地球上几乎所有已 知的蛋白质。 美国人工智能研究实验室 OpenAI新推出一种人工智能技 术驱动的自然语言处理工具— —ChatGPT(Chat Generative Pre-trained Transformer) 17 生物信息学的历史
生物信息学课程我国生物信息学的发展Bioinformatics中国生物信息学终身成就奖首批中国生物信息学终身成就奖得主简介生信史一:顾孝诚教授与北京大学生物信息中心(罗静初)生信史二:TheinternationalHumanGenomeProject(杨焕明)生信史三:EarlybioinformaticsresearchinChina(陈润生)国家基因组科学数据中心(国家生物信息中心):整合中国组学资源,打破数据孤岛陈润生院士李衍达院士郝柏林院士#家生物的惠中心#的保宽器牛计牌分析#你#娱芯政留网租随伴中文Engis3074#39.8#1247万1.59万3.79花More...白格致推务用户安撑目安持文单SRE:实时据据线0101课程网站虚拟教研室线上资源罗辽复教授张春霆院士孙之荣教授
18 生物信息学 课程 Bioinformatics 陈润生院士 李衍达院士 郝柏林院士 中国生物信息学终身成就奖 罗辽复教授 张春霆院士 孙之荣教授 • 首批中国生物信息学终身成就奖得主简介 • 生信史一:顾孝诚教授与北京大学生物信息中心(罗静初) • 生信史二:The international Human Genome Project(杨焕明) • 生信史三:Early bioinformatics research in China(陈润生) • 国家基因组科学数据中心(国家生物信息中心):整合中国 组学资源,打破数据孤岛 More. 101课程网站 虚拟教研室线 上资源 我国生物信息学的发展
生物信息学课程我国生物信息学的发展Bioinformatics中国生物信息学终身成就奖得主简介之陈润生院士科研成就:陈润生曾参加中国第一个完整基因组泉生热袍菌B4基因组序列的组装和基因标识,曾参加人类基因组1%和水稻基因组工作草图的研究;构建了收录非编码RNA及其基因的数据库NONCODE,以及收录非编码RNA与其它生物大分子相互作用的数据库NPInter。陈润生课题组主要研究方向包括但不限于:利用生物信息学手段并结合实验室多年积累的RNA组学技术,深入开展在肿瘤发生、发展以及干细胞重编程过程中长非编码RNA的系统发现和功能机制研究;非编码RNA数据库(NONCODE)非编码RNA与各种生物大分子(DNA陈润生,1941年6月18日出生,RNA及蛋白质)相互作用数据库(NPInter)以及其它专家数据库的构天津人,生物信息学家,中国科学院生物物理研究所研究员建与升级:RNA研究新技术、新方法:长非编码RNA翻译复杂性的理博士生导师。2007年当选为中论与功能机制研究;着丝粒及组成型异染色质建成过程中长非编码国科学院院士、2014年当选为RNA的功能与调控机制研究;小鼠早期胚胎发育过程中长非编码RNA国际欧亚科学院院王。的功能与调控机制研究。:生信史三:EarlybioinformaticsresearchinChina(陈润生)19
19 生物信息学 课程 Bioinformatics • 生信史三:Early bioinformatics research in China(陈润生) • 中国生物信息学终身成就奖得主简介之陈润生院士 科研成就:陈润生曾参加中国第一个完整基因组泉生热袍菌B4基因组 序列的组装和基因标识,曾参加人类基因组1%和水稻基因组工作草图 的研究;构建了收录非编码RNA及其基因的数据库NONCODE,以及 收录非编码RNA与其它生物大分子相互作用的数据库NPInter。 陈润生课题组主要研究方向包括但不限于:利用生物信息学手段并结 合实验室多年积累的RNA组学技术,深入开展在肿瘤发生、发展以及 干细胞重编程过程中长非编码RNA的系统发现和功能机制研究;非编 码RNA数据库(NONCODE)、非编码RNA与各种生物大分子(DNA、 RNA及蛋白质)相互作用数据库(NPInter)以及其它专家数据库的构 建与升级;RNA研究新技术、新方法;长非编码RNA翻译复杂性的理 论与功能机制研究;着丝粒及组成型异染色质建成过程中长非编码 RNA的功能与调控机制研究;小鼠早期胚胎发育过程中长非编码RNA 的功能与调控机制研究。 陈润生,1941年6月18日出生, 天津人,生物信息学家,中国 科学院生物物理研究所研究员、 博士生导师。2007年当选为中 国科学院院士、2014年当选为 国际欧亚科学院院士。 我国生物信息学的发展