一非极性（疏水）侧链R基团的氨基酸疏水性的氨基酸有8种，在水中溶解度较小。它们是5种脂肪烃的Ala、Val、Leu、Ile、Met，2种芳香环的Phe、Trp，1种仲胺侧链的a-亚氨基酸Pro氨基酸三字母符单字母符000-1FHNCH苯丙氨酸PheOH.H.C色氨酸WTrp（吲哚基）H.脯氨酸ProPCOONH2+
（一）非极性（疏水）侧链R基团的氨基酸 氨基酸 结构式 三字母符 单字母符 苯丙氨酸 Phe F 色氨酸 （吲哚基） Trp W 脯氨酸 Pro P C H C O O N H 3 _ + C H 2 C H C O O N H3 _ + C H2 N H 2 C O O _ + 疏水性的氨基酸有8种，在水中溶解度较小。它们是5种脂肪烃的Ala、Val、Leu、 Ile、Met，2种芳香环的Phe、Trp，1种仲胺侧链的α-亚氨基酸Pro
（二）极性但不带电荷R基团的氨基酸这组氨基酸共7种，因其R基团是不解离的极性基团，与水形成氢键，比疏水氨基酸易溶于水。-OH、-SH、-CO-NH.都是极性基团。GIy不带R基团，但氨基和羧基又很强极性占分子很大比例，也属极性分子。-SH和Tyr酚基失质子倾向最大。结构式单字母氨基酸三字母符符H-CH-COO甘氨酸GGlyNH3CH-COOHOCH2丝氨酸SerSNH.+H,C-CH-CH-COO苏氨酸TThrOHNH3+半胱氨酸HS-CH,-CH-COOCysCNH
这组氨基酸共7种，因其R基团是不解离的极性基团，与水形成氢键，比疏水氨基酸 易溶于水。-OH、-SH、-CO-NH2都是极性基团。Gly不带R基团，但氨基和羧基又 很强极性占分子很大比例，也属极性分子。-SH和Tyr酚羟基失质子倾向最大。 氨基酸 结构式 三字母符 单字母 符 甘氨酸 Gly G 丝氨酸 Ser S 苏氨酸 Thr T 半胱氨酸 Cys C H C H C O O N H 3 + _ （二）极性但不带电荷R基团的氨基酸 C H 2 C H C O O N H 3 H O + _ C H C H C O O N H 3 H 3 C O H + _ + _ C H 2 C H C O O N H 3 H S
(二)极性但不带电荷R基团的氨基酸-OH、-SH、-CO-NH-都是极性基团。GIy不带R基团，但氨基和羧基文很强极性占分子很大比例，也属极性分子。-SH和TVr酚羟基失质子倾向最大。单字母结构式三字母符氨基酸符Y酪氨酸TyrHOCh-Coo'CH2(对甲基苯酚）NH.O=N天冬酰胺AsnCh-CoO（乙酰胺）CH,NCH-NH.O=谷氨酰胺GinQ（丙酰胺）CH2CH-CHCOO-H,NCNH3K
-OH、-SH、-CO-NH2都是极性基团。Gly不带R基团，但氨基和羧基又很强极性占 分子很大比例，也属极性分子。-SH和Tyr酚羟基失质子倾向最大。 氨基酸 结构式 三字母符 单字母 符 酪氨酸 (对甲基苯酚) Tyr Y 天冬酰胺 （乙酰胺） Asn N 谷氨酰胺 （丙酰胺） Gln Q （二）极性但不带电荷R基团的氨基酸 + _ C H 2 C H C O O N H 3 H O + _ C H 2 C H C O O N H 3 C O H 2 N + _ C H 2 C H C O O N H 3 C C H 2 O H 2 N
(三)R基团带负电荷的氨基酸Asp和GIu都含有远端羧基，该-COOH在pH6-7时完全解离，因此分子在近中性介质中，带负电荷。这一类的是两种酸性氨基酸。结构式氨基酸三字母符单字母符天冬氨酸DAspCH-COO-OOCCH2-（乙酸基）NH.E谷氨酸Glu-OOC-CH2-CH2CH-COOT一（丙酸基）NH.+
（三） R基团带负电荷的氨基酸 Asp和Glu都含有远端羧基，该-COOH在pH6-7时完全解离，因此分子在近 中性介质中，带负电荷。这一类的是两种酸性氨基酸。 氨基酸 结构式 三字母符 单字母符 天冬氨酸 （乙酸基） Asp D 谷氨酸 （丙酸基） Glu E + _ C H 2 C H C O O N H 3 O O C _ + _ O O C C H 2 C H 2 C H C O O N H 3 _
（(四）R基团带正电荷的氨基酸这是一类碱性氨基酸，在pH7介质中携带净正电荷。Lys除α-NH2外，还有远端&-NH；Arg含带正电荷的胍基；His有咪唑基，它是pK值在7.O附近唯一的Aa。结构式氨基酸三字母单字母符符K赖氨酸LysNH,-CH,CH,CH,-CH,-CH-COO-NH.精氨酸RArgNHCH2CH2-CH2-CH-COOH,N一C1(胍基）NH.NH2组氨酸HHisCh-COo-CH2一（咪唑基）HNNHNH.X
这是一类碱性氨基酸，在pH7介质中携带净正电荷。Lys除α-NH2 外，还有远端 ε-NH2 ；Arg 含带正电荷的胍基；His有咪唑基，它是pK值在7.0附近唯一的Aa。 氨基酸 结构式 三字母 符 单字母 符 赖氨酸 Lys K 精氨酸 （胍基） Arg R 组氨酸 （咪唑基） His H （四） R基团带正电荷的氨基酸 + _ C H 2 C H 2 C H 2 C H C O O N H 3 N H 3 C H 2 + + _ CH2 CH2 CH2 CH COO NH3 H2N C NH NH2 + + _ H N N H C H 2 C H C O O N H 3 +