大规模的未知突变筛查的DNA芯片分析 n个碱基中每个碱基的变异, 需探针4×n; 4kb序列,需4×400=106000 个寡核苷酸探针
大规模的未知突变筛查的DNA芯片分析 n个碱基中每个碱基的变异, 需探针4×n; 4 kb序列, 需4×4000=16000 个寡核苷酸探针
大规模的未知突变的DNA芯片技术分析 CG|○○○ 探针定位正常 C→>T 纯合子 C→>GC→A 杂合子 新突变 新突变
大规模的未知突变的DNA芯片技术分析 A T C G 探针定位 正常 C T 纯合子 C T 杂合子 C G 新突变 C A 新突变
2.大片段丢失或插入的诊断 PCR:0.5-15 kb dna片段的丢失或插入 多重PCR( multiplex PCr):在同一个PCR体系 中加入多对引物,扩增同一模板的几个区域 引物1 引物3 产物1 产物2 引物2引物4
2. 大片段丢失或插入的诊断 PCR: 0.5-1.5 kb DNA片段的丢失或插入 多重PCR ( multiplex PCR): 在同一个PCR体系 中加入多对引物, 扩增同一模板的几个区域 引物1 引物3 引物2 引物4 致病基因 产物1 产物2
多重PCR引物设计 1)产物大小易于分离 2)引物23-28nt,较高特异性 3)G+C含量相近,55%左右 4)优化PCR条件,以适应多对引物扩增的要求
多重PCR引物设计 1)产物大小易于分离 2)引物23-28 nt, 较高特异性 3) G+C含量相近, 55%左右 4) 优化PCR条件, 以适应多对引物扩增的要求
进行性肌营养不良症(DMD 基因全长2000-2500kb 60%缺失突变,5%重复突变, 35%小片段缺失或点突变 突变的热点区在基因的中央部第45-55外显 子和5区 外显子4、8、12、17、19、44、45、48、 5位点的9对引物,检出90%的具有基因缺 失的病例
进行性肌营养不良症(DMD) 基因全长2000-2500kb 60%缺失突变, 5%重复突变, 35%小片段缺失或点突变 突变的热点区在基因的中央部第45-55外显 子和5’区 外显子4、8、12、17、19、44、45、48、 51位点的9对引物, 检出90%的具有基因缺 失的病例