蛋白质蛋白质(protein)是由氨基酸以“脱水缩合”的方式组成的多肽链经过盘曲折叠形成的具有一定空间结构的物质。蛋白质组学是指一种基因组所表达的全套蛋白质。蛋白质组研究即在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平、翻译后的修饰、蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上关于疾病发生、细胞代谢等过程的整体认识PrimarySecondaryTertiaryQuaternarystructurestructurestructurestructure构成细胞和生物体结构的重要物质Lys催化细胞内的生理生化反应LysGly运输载体(血红蛋白)GlyLeu传递信息,调节机体的生命活动(胰岛素)VallAla免疫功能(抗体)HisAmino acid residuesαHelixPolypeptide chainAssembledsubunits
蛋白质 ➢ 构成细胞和生物体结构的重要物质 ➢ 催化细胞内的生理生化反应 ➢ 运输载体(血红蛋白) ➢ 传递信息,调节机体的生命活动(胰岛素) ➢ 免疫功能( 抗体) 蛋白质(protein)是由氨基酸以“脱水缩合”的方式组成的多肽链经过盘曲折叠形成的具有一定空间结构 的物质。 蛋白质组学是指一种基因组所表达的全套蛋白质。蛋白质组研究即在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括 蛋白质的表达水平、翻译后的修饰、蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上关于疾病发生、细胞代 谢等过程的整体认识
中心法则分子生物学中心法则DNA是生物遗传的主要物质基础,生复制物机体的遗传信息以密码的形式编码DNA在DNA分子上,表现为特定的核苷酸排列顺序。1958年Crick提出了“中心法则”(Centraldogma),揭示了遗传信息的传递规律。美RNA蛋白质翻译
DNA是生物遗传的主要物质基础,生 物机体的遗传信息以密码的形式编码 在DNA分子上,表现为特定的核苷酸 排列顺序。1958年Crick提出了“中心 法则” (Central dogma),揭示了遗 传信息的传递规律。 中心法则
单细胞测序技术单细胞测序传统基因测序是指在单个细胞水平上,对基因组转录组等进行测序分析的一项新技术它能够弥补传统高通量测序的局限性揭示细胞间的异质性。VS三平均基因表达单个细胞基因表达
单细胞测序技术 V S 传统基因测序 单细胞测序 是指在单个细胞水平上,对基因组、 转录组等进行测序分析的一项新技术, 它能够弥补传统高通量测序的局限性, 揭示细胞间的异质性。 平均基因表达 单个细胞基因表达
单细胞测序流程IsolateandsequenceTissue (e.g.tumor)individual cellsGene1Cell1相比传统测序,单细胞测序需要先将组织或体液中的细ComparegeneexpressionRead Countsprofilesof singlecells胞群分离成单个细胞,而这Cell1Cell2也恰恰是难点之处。180Gene1saaGene21010506Gene3049220Gene4CellsPrincipalComponent1(http://learn.gencore.bio.nyu.edu)单细胞测序流程主要包括单细胞分离、单细胞捕获、cDNA扩增和文库制备以及测序分析
单细胞测序流程 单细胞测序流程主要包括单细胞分离、单细胞捕获、cDNA扩增和文库制备以及测序分析 相比传统测序,单细胞测序 需要先将组织或体液中的细 胞群分离成单个细胞,而这 也恰恰是难点之处
单细胞悬液的制备》一般建议拿到新鲜样本后直接开展细胞解离,但受限于实验条件等客观因素的限制,获取的临床样本或动物样本无法立即开展解离实验,因此就需要选择合适的离体样本保存策略》保存原则:细胞悬液的高细胞活性、高保真度(细胞状态不发生明显变化)、低背景噪音新鲜样本直接解离新鲜样本在低温(4℃)保存液中保存转运后解离(24-48h)保存或运输样本冻存(采用甘油或二甲基亚砜作为保护剂)甲醛固定细胞解离和圈定采集样本运行单重或细胞多重分析样本速冻抽核
单细胞悬液的制备 ➢ 一般建议拿到新鲜样本后直接开展细胞解离,但受限于实验条件等客观因素的限制,获取的临床样本或动 物样本无法立即开展解离实验,因此就需要选择合适的离体样本保存策略 ➢ 保存原则:细胞悬液的高细胞活性、高保真度(细胞状态不发生明显变化)、低背景噪音 • 新鲜样本直接解离 • 新鲜样本在低温(4℃)保存液 中保存转运后解离(24-48h) • 样本冻存(采用甘油或二甲基 亚砜作为保护剂) • 甲醛固定细胞 • 样本速冻抽核