DNA分子的体外连接一:实验目的及背景·在一定条件下DNA连接酶催化两个双链DNA片段相的5端磷酸与3端羟基之间形成磷酸酸脂键.DNA分子的接是在酶切反应获得互补序列基础上进行的。常用的两种DNA连接酶:(1)大肠杆菌的DNA连接酶(2)噬菌体的T.DNA连接酶。·DNA连接酶的最适反应温度为37℃C,但在此温度下,粘性末未端的氢键结合很不稳定,折衷方法是12℃过夜
DNA分子的体外连接 一.实验目的及背景 • 在一定条件下,DNA连接酶催化两个双链DNA片段相 邻的5’端磷酸与3’端羟基之间形成磷酸酸脂键,DNA分 子的连接是在酶切反应获得互补序列基础上进行的。 常用的两种DNA连接酶: (1) 大肠杆菌的DNA连接酶, (2) 噬菌体的T4DNA连接酶。 • DNA连接酶的最适反应温度为37℃,但在此温度 下, 粘性末端的氢键结合很不稳定,折衷方法是12℃ 过夜
·DNA的未端性质由于内切酶产生的DNA末端有平未端和粘性未端,因而连接反应中就有平末端连接和粘性末端连接。粘性末端连接效率高,因而在底物浓度,酶浓度选择上有差异。·碱性磷酸酶处理质粒载体为提高连接效率,一般采取提高DNA的浓度,来增加重组子比例,可是这又会引起DNA自身连接的问题。为此,通常选择对载体进行碱性磷酸酶处理,除去其5'未端的磷酸基,防止自身环化。·连接反应的检测连接反应成功与否,要通过下一步实验,转化宿主菌,对阳性克隆的筛选来确定
• DNA的末端性质 由于内切酶产生的DNA末端有平未端和粘性末端,因 而连接反应中就有平末端连接和粘性末端连接。 粘性末 端连接效率高,因而在底物浓度,酶浓度选择上有差异。 • 碱性磷酸酶处理质粒载体 为提高连接效率,一般采取提高DNA的浓度,来增加 重组子比例,可是这又会引起DNA自身连接的问题。为 此,通常选择对载体进行碱性磷酸酶处理,除去其5’末端 的磷酸基,防止自身环化。 • 连接反应的检测 连接反应成功与否,要通过下一步实验,转化宿主菌, 对阳性克隆的筛选来确定
二、实验试剂1.纯化后的酶切质粒载体和目的基因。2.10XTDNA连接酶buffer200mMTris-HCI(pH7.6)50mMMgCI250mM二硫糖醇500μl/mlBSA3.TDNA连接酶三、实验步骤胶回收载体(EcoRI/HindII)3 μl (~50ng)连接反应:胶回收插入片段(EcoRI/Hind)5.5μl(~50ng)T4 DNA Ligase0.5ul10xbuffer1 μl总体积(两人一组)10 μl盖上管盖,混匀,台式离心机上离心5秒。20℃连接1小时。反应结束后于-20℃保存
二、实验试剂 1. 纯化后的酶切质粒载体和目的基因。 2. 10× T4 DNA连接酶buffer 200mM Tris-HCl(pH7.6) 50mM MgCl2 50mM 二硫苄糖醇 500μl/ml BSA 3. T4 DNA连接酶 三、实验步骤 胶回收载体(EcoR I /HindIII ) 3 µl(~50ng) 胶回收插入片段(EcoR I /HindIII ) 5.5 µl (~50ng) T4 DNA Ligase 0.5ul10X buffer 1 µl 总体积 10 µl (两人一组) 盖上管盖,混匀,台式离心机上离心5秒。20℃ 连接1小时。反应结束后于-20℃保存。 连接反应:
四、问题与讨论:1.简述T4DNA连接酶作用机理2.简述一个完整外源DNA的克隆过程3.连接反应中应注意些什么问题及如何提高连接效率
四、问题与讨论: 1. 简述T4 DNA连接酶作用机理。 2. 简述一个完整外源DNA的克隆过程。 3. 连接反应中应注意些什么问题及如何提高连接效率
感受态细胞的制备与DNA的转化一:实验目的及背景(一)什么是感受态细胞(Competent cell)?细胞处于能够吸收外源DNA的状态称感受态,经特殊处理后处于此状态的细胞称感受态细胞(1)细胞表面暴露出一些可接受外来DNA的位点(以溶菌酶处理,可促使受体细胞的接受位点充分暴露)(2)细胞膜通透性增加(用钙离子处理,可使膜通透性增加,使DNA直接穿过质膜进入细胞)。(3)受体细胞为限制修饰酶缺陷型,使转入的DNA分子不易被切除或破坏
感受态细胞的制备与DNA的转化 (1)细胞表面暴露出一些可接受外来DNA的位点(以 溶菌酶处理,可促使受体细胞的接受位点充分暴露)。 (2)细胞膜通透性增加(用钙离子处理,可使膜通透 性增加,使DNA直接穿过质膜进入细胞)。 (3)受体细胞为限制修饰酶缺陷型,使转入的DNA分 子不易被切除或破坏。 (一) 什么是感受态细胞(Competent cell )? 细胞处于能够吸收外源DNA的状态称感受态,经 特殊处理后处于此状态的细胞称感受态细胞。 一.实验目的及背景