刘新文。基因组哟与医学 大规模测定基因组DNA序列 (Large Scale DNA Sequencing) 1.基于BAc连续克隆系的测序 2全基因组的“鸟枪法”( shotgun)测序 3cDNA测序 DNA序列的生物信息学分析 ( Bioinformatics Analysis of DNA Sequences
刘新文,基因组学与医学 1. 基于BAC连续克隆系的测序 2. 全基因组的“鸟枪法”(shotgun)测序 3. cDNA测序 二、大规模测定基因组DNA序列 (Large Scale DNA Sequencing) 三、DNA序列的生物信息学分析 (Bioinformatics Analysis of DNA Sequences)
刘新文。基因组哟与医学 第二节功能基因组学 (Functional Genomics) 鉴定(注释)基因 分析基因功能 鉴定基因变异 描述基因表达模式 生物信息学
刘新文,基因组学与医学 第二节 功能基因组学 (Functional Genomics) Ø鉴定(注释)基因 Ø分析基因功能 Ø鉴定基因变异 Ø描述基因表达模式 Ø生物信息学
刘新文。基因组哟与医学 、概念及特点 1.概念:利用结构基因组学提供的信息,以高通量 大规模实验方法及统计与计算机分析为特征,全面 系统地分析全部基因及其编码蛋白的功能。包括 生物学功能、细胞学功能、发育学功能等。 研究内容 、鉴定DNA序列中的基因。 2、确定基因功能。 (1)利用同源搜索分析基因功能。 (2)实验分析基因功能
刘新文,基因组学与医学 1. 概念:利用结构基因组学提供的信息,以高通量, 大规模实验方法及统计与计算机分析为特征,全面 系统地分析全部基因及其编码蛋白的功能。包括: 生物学功能、细胞学功能、发育学功能等。 一、概念及特点 二、研究内容 1、鉴定DNA序列中的基因。 2、确定基因功能。 (1)利用同源搜索分析基因功能。 (2)实验分析基因功能
刘新文。基因组哟与医学 3、描述基因表达模式:基因表达的时空性 >转录组 transcriptome):指一个细胞内的一套 mRNA转录物,包含了在某一环境条件、某一生命阶 段、某一生理或病理(功能)状态下,生命体的细胞 或组织所表达的基因种类和水平。 >蛋白质组( proteome)指一个细胞内的全套蛋白质, 反映了特殊阶段、环境、状态下细胞或组织在翻译水 平的蛋白质表达谱。 4、基因产物的结构与功能预测 5、人类基因组序列变异性 6、生物信息学
刘新文,基因组学与医学 Ø 转录组(transcriptome):指一个细胞内的一套 mRNA转录物,包含了在某一环境条件、某一生命阶 段、某一生理或病理(功能)状态下,生命体的细胞 或组织所表达的基因种类和水平。 Ø 蛋白质组(proteome):指一个细胞内的全套蛋白质, 反映了特殊阶段、环境、状态下细胞或组织在翻译水 平的蛋白质表达谱。 3、描述基因表达模式:基因表达的时空性 4、基因产物的结构与功能预测 5、人类基因组序列变异性 6、生物信息学
刘新文。基因组哟与医学 第三节比较基因组学 (Comparative Genomics) 比较基因组学涉及比较不同物种的整个基 因组,以便深入理解每个基因组的功能和进化 关系
刘新文,基因组学与医学 第三节 比较基因组学 (Comparative Genomics) 比较基因组学涉及比较不同物种的整个基 因组,以便深入理解每个基因组的功能和进化 关系