标注样例2：对新诊断的肾病患者需检测抗核抗体、抗-sDNA抗体 1.5手术 手术指医生用医疗器械对病人身体进行的切除、缝合等治疗，以刀、剪、针 等器械在人体局部进行的操作，来维持患者的健康，是外科的主要治疗方法2). 本规范使用ICD-9-CM和MeSH医学词表中编码为E的手术概念米界定手术实 体涵盖的范围但不局限于ICD-9-CM和MeSH医学词表中的概念.在标注时，仅 标注具体的手术方式 标注样例1：少数患者选择肝脏移植 标注样例2：对血红蛋白H病和中间型B地中海贫血，脾切除应在56岁以后施 行并严格掌握适应证 1.6药物 药物是指用来预防、治疗及诊断疾病的物质。在理论上，药物是指凡能影响 机体器官生理功能及细胞代谢活动的化学物质都属于药物的范畴。本规范使用 ATC、MSH医学词表编码为D的药物以及丁香园药物网站的概念来界定药物实 体涵盖的范围但不局限于ATC和MSH医学词表中的概念.常见实体类型是类 固醇、中药、化学药、生物药物、抗生素等。在标注中仅标注药物的名称 标注样例1：非甾体类抗炎药可以有效的减少疼痛】 标注样例2：通常拉贝洛尔和硝苯地平可以作为备选药物。 1.7其他治疗 治疗指为了解决疾病或者缓解症状而施加给患者的治疗程序、干预措施、给
标注样例 2：对新诊断的肾病患者需检测抗核抗体、抗-dsDNA 抗体 1.5 手术 手术指医生用医疗器械对病人身体进行的切除、缝合等治疗，以刀、剪、针 等器械在人体局部进行的操作，来维持患者的健康，是外科的主要治疗方法[2]。 本规范使用 ICD-9-CM 和 MeSH 医学词表中编码为 E 的手术概念来界定手术实 体涵盖的范围但不局限于 ICD-9-CM 和 MeSH 医学词表中的概念。在标注时，仅 标注具体的手术方式。 标注样例 1：少数患者选择肝脏移植。 标注样例 2：对血红蛋白 H 病和中间型β地中海贫血，脾切除应在 5~6 岁以后施 行并严格掌握适应证。 1.6 药物 药物是指用来预防、治疗及诊断疾病的物质。在理论上，药物是指凡能影响 机体器官生理功能及细胞代谢活动的化学物质都属于药物的范畴。本规范使用 ATC、MeSH 医学词表编码为 D 的药物以及丁香园药物网站的概念来界定药物实 体涵盖的范围但不局限于 ATC 和 MeSH 医学词表中的概念。常见实体类型是类 固醇、中药、化学药、生物药物、抗生素等。在标注中仅标注药物的名称。 标注样例 1：非甾体类抗炎药可以有效的减少疼痛。 标注样例 2：通常拉贝洛尔和硝苯地平可以作为备选药物。 1.7 其他治疗 治疗指为了解决疾病或者缓解症状而施加给患者的治疗程序、干预措施、给
予药品[3).本规范中，其他治疗是指不包含手术、药物的治疗方式.使用《国际 疾病分类手术与操作》(ICD-9-CM-3)来界定其他治疗实体涵盖的范围但不局限 于I1CD-9-CM-3中的概念. 标注样例1：针对慢性胃炎的饮食治疗有养成良好的饮食习惯，避免食用刺激性 食物 1.8流行病学 流行病学是研究特定人群中疾病、健康状况的分布及其决定因素，并辅助于 研究如何防治疾病及促进健康的，实体取值为字符串， 范围较 标注样例1：肺癌发生率在黑人和非西班牙裔白人中最高. 标注样例2：流行性腮腺炎全年均可发生感染流行，但以冬春季发病较多。 1.9社会学 社会学是一种社会现象的实际情况和有关的现象发生的原因的机制，在这里 特指与疾病发生有关的因素，实体取值为字符串，范围较广.本规范中，社会学 主要包括与疾病有关的病因、发病机制、高危因素、病理生理等。 标注样例1：垂体卒中是现存腺瘤突发梗死或出血引起。 标注样例2饥饿、全胃肠外营养、麻醉性镇痛药和久坐不动是非结石性急性胆 囊炎的诱发因素 1.10预后 预后是指对患者的疾病过程、治疗效果、最终转归的一种估计。本规范中包 含预后情况、预后生存率和预后生存时间
予药品[3]。本规范中，其他治疗是指不包含手术、药物的治疗方式。使用《国际 疾病分类手术与操作》(ICD-9-CM-3)来界定其他治疗实体涵盖的范围但不局限 于 ICD-9-CM-3 中的概念。 标注样例 1：针对慢性胃炎的饮食治疗有养成良好的饮食习惯，避免食用刺激性 食物 1.8 流行病学 流行病学是研究特定人群中疾病、健康状况的分布及其决定因素，并辅助于 研究如何防治疾病及促进健康的，实体取值为字符串，范围较广。 标注样例 1：肺癌发生率在黑人和非西班牙裔白人中最高。 标注样例 2：流行性腮腺炎全年均可发生感染流行，但以冬春季发病较多。 1.9 社会学 社会学是一种社会现象的实际情况和有关的现象发生的原因的机制，在这里 特指与疾病发生有关的因素，实体取值为字符串，范围较广。本规范中，社会学 主要包括与疾病有关的病因、发病机制、高危因素、病理生理等。 标注样例 1：垂体卒中是现存腺瘤突发梗死或出血引起。 标注样例 2：饥饿、全胃肠外营养、麻醉性镇痛药和久坐不动是非结石性急性胆 囊炎的诱发因素。 1.10 预后 预后是指对患者的疾病过程、治疗效果、最终转归的一种估计。本规范中包 含预后情况、预后生存率和预后生存时间
标注样例1：过敏性紫藏预后一般良好，除少数重症患儿可死于肠出血、肠套叠 肠坏死 1.11其他 其他类实体反应了与疾病密切相关的信息，是临床数据信息的重要组成部分， 在本规范中包括疾病的发病阶段、就诊科室、标准出院时间、出院标准、预防 注意事项。 标注样例1：近年来国内外正在研制EB病毒疫苗，除了可预防传染性单核细胞 增多症，尚考虑用于与EBV感染相关疾病 标注样例2：儿童若患哮喘可去呼吸科就诊 1.12标注注意事项 1、疾病、药物、检查、手术具有明确实体边界。其他实体为不确定长度的字符 串 2、命名实体标注遵循主要原则：不重叠、不嵌套、尽可能不含有标点符号(、，：) 及连接词（或、和、以及），以及实体最短原则（介词、动词、前缀词、后缀词 序号等都不需要标注)· 3、与药物类实体有关的特殊实体若以“治疗”等结尾，在标注时，只标注药物 名称不标注尾词。若提到化疗，将其标注为关系属性。药物的用法、用量和疗效 等作为药物的属性分别进行标注。 4、与手术类实体有关的特殊实体若以“治疗”等结尾，在标注时，只标注手术 名称不标注尾词
标注样例 1：过敏性紫癜预后一般良好，除少数重症患儿可死于肠出血、肠套叠、 肠坏死 1.11 其他 其他类实体反应了与疾病密切相关的信息，是临床数据信息的重要组成部分。 在本规范中包括疾病的发病阶段、就诊科室、标准出院时间、出院标准、预防、 注意事项。 标注样例 1：近年来国内外正在研制 EB 病毒疫苗，除了可预防传染性单核细胞 增多症，尚考虑用于与 EBV 感染相关疾病。 标注样例 2：儿童若患哮喘可去呼吸科就诊。 1.12 标注注意事项 1、疾病、药物、检查、手术具有明确实体边界。其他实体为不确定长度的字符 串。 2、命名实体标注遵循主要原则：不重叠、不嵌套、尽可能不含有标点符号（、，。：；） 及连接词（或、和、以及），以及实体最短原则（介词、动词、前缀词、后缀词、 序号等都不需要标注）。 3、与药物类实体有关的特殊实体若以“治疗”等结尾，在标注时，只标注药物 名称不标注尾词。若提到化疗，将其标注为关系属性。药物的用法、用量和疗效 等作为药物的属性分别进行标注。 4、与手术类实体有关的特殊实体若以“治疗”等结尾，在标注时，只标注手术 名称不标注尾词
5、同义词关系的实体一和实体二必须为同一类型，实体的与其英文名称之间也 属于同义词关系 6、属性标注时遵循优先表示实体属性原则.一对实体之间实体关系可以有多种， 若一对实体存在不同类型的属性，请分开标注 2.疾病类实体关系描述及标注规范 实体关系标注在命名实体标注的基础上展开，本文以疾病类实体为中心，对 来源的医学资源中出现的实体赋予预先定义好的关系类型，本规范围绕以疾病为 中心，拓展疾病与其他实体间的关系，每种关系下面细分为子关系，共49种子 关系。这49种子关系不局限于一个句子范围内的实体关系，还包括跨段句子范 围内的关系。本规范中，关系抽取的输出是一个六元组（实体1-属性，实体2 属性，关系-属性)实体关系如表1所示 表1疾病类实体关系表 实体1 关系类型 实体2 实体1 关系类型 实体2 疾病 疾病分型 疾病 疾病 发病率 流行病学 鉴别诊断 死亡率 并发症 潜伏期 并发症《药物) 多发地区 并发症（术后） 多发群体 相关（导致） 多发季节 相关（转化） 传播途径 相关（症状） 疾病 病因 社会学 疾病 发病部位 部位 病理生理 累及部位 发病机制 疾病 临床症状 症状 高危因素 临床体征 遗传因素 治疗后症状 病史 疾病 辅助检查 检查 疾病 预后状况 预后 影像学检查 预后生存率 病理学检查 预后生存时间 内窥镜检查 疾病 阶段 其他
5、同义词关系的实体一和实体二必须为同一类型，实体的与其英文名称之间也 属于同义词关系。 6、属性标注时遵循优先表示实体属性原则。一对实体之间实体关系可以有多种， 若一对实体存在不同类型的属性，请分开标注。 2.疾病类实体关系描述及标注规范 实体关系标注在命名实体标注的基础上展开，本文以疾病类实体为中心，对 来源的医学资源中出现的实体赋予预先定义好的关系类型。本规范围绕以疾病为 中心，拓展疾病与其他实体间的关系，每种关系下面细分为子关系，共 49 种子 关系。这 49 种子关系不局限于一个句子范围内的实体关系，还包括跨段句子范 围内的关系。本规范中，关系抽取的输出是一个六元组（实体 1-属性，实体 2- 属性，关系-属性）。实体关系如表 1 所示。 表 1 疾病类实体关系表 实体 1 关系类型 实体 2 实体 1 关系类型 实体 2 疾病 疾病分型 疾病 疾病 发病率 流行病学 鉴别诊断 死亡率 并发症 潜伏期 并发症（药物） 多发地区 并发症（术后） 多发群体 相关（导致） 多发季节 相关（转化） 传播途径 相关（症状） 疾病 病因 社会学 疾病 发病部位 部位 病理生理 累及部位 发病机制 疾病 临床症状 症状 高危因素 临床体征 遗传因素 治疗后症状 病史 疾病 辅助检查 检查 疾病 预后状况 预后 影像学检查 预后生存率 病理学检查 预后生存时间 内窥镜检查 疾病 阶段 其他
实验室检查 预防 筛查 就诊科室 疾病 药物治疗 药物 标注住院时间 疾病 手术治疗 手术 出院标准 疾病 铺助治疗 其他治疗 注意事项 任意实体同义词 与实体1相同 2.1实体关系的属性描述 疾病类实体关系中的属性一般指对实体和关系的修饰、解释说明和条件限制 等，在三元组中，两个实体及其之间的关系均可通过增加属性来补充更具体的信 息，实体的属性通常为该实体的修饰词，如疾病的发生阶段，实体关系的属性通 常为关系发生的条件或对其的精确描述。为了方便表达，在本规范中用)来表 示实体、实体关系的属性。如<实体一实体仁-实体关系0>.标注 时遵循优先表示实体属性原则。一对实体之间实体关系可以有多种，即若一对实 体存在不同类型的属性，请分开标注.具体属性标注方法请参看每小节. 标注样例1：反流性食管炎常见症状：婴幼儿表现为烦躁、拒食，年长儿诉吞咽 疼痛。 <反流性食管炎-烦躁-临床症状（婴幼儿）> <反流性食管炎一吞咽疼痛-临床症状（年长儿）> 标注样例2：急性肾炎临床表现轻重悬殊，咽炎为诱因者病前612天（平均10 天)多有发热 <急性肾炎（咽炎为诱因）-发热（病前612天（平均10天）)-临床症状 标注样例3：维生素A缺乏症在5岁以下儿童的发病率远高于成人 <维生素A缺乏症-儿童(5岁以下)-多发群体 标注样例4：在阿米巴病患者中，轻者只有腹部不适，食欲缺乏
实验室检查 预防 筛查 就诊科室 疾病 药物治疗 药物 标注住院时间 疾病 手术治疗 手术 出院标准 疾病 辅助治疗 其他治疗 注意事项 任意实体 同义词 与实体 1 相同 2.1 实体关系的属性描述 疾病类实体关系中的属性一般指对实体和关系的修饰、解释说明和条件限制 等。在三元组中，两个实体及其之间的关系均可通过增加属性来补充更具体的信 息。实体的属性通常为该实体的修饰词，如疾病的发生阶段，实体关系的属性通 常为关系发生的条件或对其的精确描述。为了方便表达，在本规范中用（）来表 示实体、实体关系的属性。如<实体一（）-实体二（）-实体关系（）>。标注 时遵循优先表示实体属性原则。一对实体之间实体关系可以有多种，即若一对实 体存在不同类型的属性，请分开标注。具体属性标注方法请参看每小节。 标注样例 1：反流性食管炎常见症状：婴幼儿表现为烦躁、拒食，年长儿诉吞咽 疼痛。 <反流性食管炎-烦躁-临床症状（婴幼儿）> <反流性食管炎-吞咽疼痛-临床症状（年长儿）> 标注样例 2：急性肾炎临床表现轻重悬殊，咽炎为诱因者病前 6~12 天（平均 10 天）多有发热。 <急性肾炎（咽炎为诱因）-发热（病前 6~12 天（平均 10 天））-临床症状> 标注样例 3：维生素 A 缺乏症在 5 岁以下儿童的发病率远高于成人。 <维生素 A 缺乏症-儿童（5 岁以下）-多发群体> 标注样例 4：在阿米巴病患者中，轻者只有腹部不适，食欲缺乏