上游充通大学 SHANGHAI JIAO TONG UNIVERSITY 纵子启动子DNADNA调节基因 结构基因 DNA- ☐翅口中I■N77/WWA RNA IRNA tRNA mRNA mRNA 多聚酶 调节蛋白 多肽婕 蛋白质 氨基酸 核糖林 图4-1各类基因或DNA区段之间的相互关系
上游充通大学 现代基因阶段 SHANGHAI JIAO TONG UNIVERSITY 跳跃基因(leap gene):是指能够改变自身位置的一段DNA序列， 也叫“转座元”，可在染色体内或不同染色体间移动，其本身可编 码转座酶(transposase),也含有非蛋白编码序列。 重复基因(repeat gene),指在真核基因组中具有一份以上拷贝的 基因，这些拷贝或在一条染色体上串联排列，或分散到多条染色体 上。 重叠基因(overlapping gene),指公用一段DNA序列的两个或两个 以上结构基因的互称，这与“互不沾染、单个分离”的传统基因概念相 悖。 假基因(seudogene)看似正常基因，却不能表达任何RNA或蛋白 质。 隐蔽基因(cryptogene):需要编辑才能正常表达的基因。 在基因组时代，基因的概念主要基于“三种方法”和“五个标准”原则
现代基因阶段 跳跃基因（leap gene）：是指能够改变自身位置的一段DNA序列， 也叫“转座元” ，可在染色体内或不同染色体间移动，其本身可编 码转座酶（transposase），也含有非蛋白编码序列。 重复基因（repeat gene），指在真核基因组中具有一份以上拷贝的 基因，这些拷贝或在一条染色体上串联排列，或分散到多条染色体 上。 重叠基因（overlapping gene），指公用一段DNA序列的两个或两个 以上结构基因的互称，这与“互不沾染、单个分离”的传统基因概念相 悖。 假基因（seudogene）看似正常基因，却不能表达任何RNA或蛋白 质。 隐蔽基因（cryptogene）：需要编辑才能正常表达的基因。 在基因组时代，基因的概念主要基于“三种方法”和“五个标准”原则
上游文通大学 SHANGHAI JIAO TONG UNIVERSITY CW.P.Armstrong 2000 1932年，美国遗传学家 B.McClintock发现玉 米籽粒色斑不稳定遗传 现象。1951年首次提出 转座子的概念，认为在 基因组的不同区域存在 可移动的控制因子， controlling element。 ©w.R.Armstrong2o01 1983年获诺贝尔奖
1932年，美国遗传学家 B. McClintock 发现玉 米籽粒色斑不稳定遗传 现象。1951年首次提出 转座子的概念，认为在 基因组的不同区域存在 可移动的控制因子， controlling element。 1983年获诺贝尔奖
(a) mRNA Viral strand DNA synthesis H A A translation begins here A mRNA G X174 Complementary strand DNA synthesis mRNA Segment of Spacer X174 DNA genome (b) A A(A) K Protein Ala) Gly(Lys STOPI DNA Sequence GCTGGTGGAAAATGAGGAAATTCAAT K Protein Leu Val GIu Asn GIu GIn Copyright1997.by John Wiley Sons.Inc.All rights reserved
上游充通大兽 “三种方法”和“五个标准”原则 SHANGHAI JIAO TONG UNIVERSITY 三种方法是： ⊕ (1)cDNA克隆和poly(A)+mRNA的表达序列标签(expressed sequence tag,EST)测序； (2)比较基因组分析鉴定保守的编码区； (3)计算机预测高丰度、高表达和进化上保守的蛋白编码基因，但是这种 方法在预测中必然会低估其他基因的数目，比如“非编码RNA(cRNA)基 因”。 五个标准： ①开放阅读框(open reading frame,ORF),通过基因组中大的开 放阅读框的鉴定来发现蛋白编码基因； ②DNA序列特征，运用密码偏爱（codon bias)和剪接位点等特异 序列特征有助于锁定基因，再根据计算机程序即可预测近50%的开 放阅读框和20%的完整基因；
“三种方法”和“五个标准”原则 三种方法是： （1）cDNA克隆和poly(A)+mRNA的表达序列标签（expressed sequence tag，EST）测序； （2）比较基因组分析鉴定保守的编码区； （3）计算机预测高丰度、高表达和进化上保守的蛋白编码基因，但是这种 方法在预测中必然会低估其他基因的数目，比如“非编码 RNA（ncRNA）基 因”。 五个标准： ①开放阅读框（open reading frame，ORF），通过基因组中大的开 放阅读框的鉴定来发现蛋白编码基因； ②DNA序列特征，运用密码偏爱（codon bias）和剪接位点等特异 序列特征有助于锁定基因，再根据计算机程序即可预测近50％的开 放阅读框和20％的完整基因；