213微卫星标记 早在1974年,Skinner等就在寄居蟹的基因组中发 现了含TAGG重复单位的简单重复序列.随后人们在动 物和酶母的基因组中都发现了大量的简单重复序列因 为其重复单位比小卫星的短称为微卫星 (microsatellite).一般认为微卫星是由1~6bp碱基为核心 序列组成一个重复单位,头尾相连的串联重复序列
2.1.3 微卫星标记 早在1974年,Skinner等就在寄居蟹的基因组中发 现了含TAGG重复单位的简单重复序列.随后人们在动 物和酶母的基因组中都发现了大量的简单重复序列因 为其重复单位比小卫星的短,称为微卫星 (microsatellite).一般认为微卫星是由1~6bp碱基为核心 序列组成一个重复单位,头尾相连的串联重复序列
微卫星序列存在于真核生物的基因组中,量多且均匀 分布就某一微卫星而言,其重复数是可变的,一般为 10~20次左右,这构成了微卫星多态性的基础微卫星在 结构上类似于小卫星,二者的区别是:微卫星的核心序 列更小,且在基因组中呈均匀分布,而小卫星的核心序 列稍大,约为10~25bp,且主要分布于非编码区,如基因 间的间隔区和基因的内含子中
微卫星序列存在于真核生物的基因组中,量多且均匀 分布.就某一微卫星而言,其重复数是可变的,一般为 10~20次左右,这构成了微卫星多态性的基础.微卫星在 结构上类似于小卫星,二者的区别是:微卫星的核心序 列更小,且在基因组中呈均匀分布;而小卫星的核心序 列稍大,约为10~25bp,且主要分布于非编码区,如基因 间的间隔区和基因的内含子中
微卫星DNA一般位于内含子中,因此它在进化过程 中受到选择压力较小,与其他分子标记相比,微卫 星在多态性,群体平均杂合度,以及群体间遗传距 离等方面,微卫星位点值均高于蛋白质位点,用微 卫星作为遗传标记更适合于这些方面的分析,同样 也更适于检测个体间的差异,微卫星DNA为共显性 遗传,利用PCR及电泳检测相对容易,也更便于实 现自动化,可通过计算杂合度,较好的进行个体鉴 -AFLP标记
微卫星DNA一般位于内含子中,因此它在进化过程 中受到选择压力较小,与其他分子标记相比,微卫 星在多态性,群体平均杂合度,以及群体间遗传距 离等方面,微卫星位点值均高于蛋白质位点,用微 卫星作为遗传标记更适合于这些方面的分析,同样 也更适于检测个体间的差异,微卫星DNA为共显性 遗传,利用PCR及电泳检测相对容易,也更便于实 现自动化,可通过计算杂合度,较好的进行个体鉴 定。 AFLP标记
2.1.5PCR-SSCP标记 DNA片段的分离和检测离不开疑胶电泳技术 前面提及的各种分子标记都是借助凝胶电泳检测双 链DNA片段是否在长度上表现出多态性,从而寻找 标记对在长度上没有差异但在序列组成发生变化 的DNA片段(如点突变引起),不能通过一般的凝胶电 泳予以区别,所谓的单链构象多态性(Single Strand Conformational Polymorphism,SSCP)就是在一种不 同的电泳分离技术基础上,从理论上说它能检测出 待分析DNA片段内的基因突变,碱基插入或缺失等 所有的DNA多态性位点
2.1.5 PCR-SSCP标记 DNA片段的分离和检测离不开凝胶电泳技术. 前面提及的各种分子标记都是借助凝胶电泳检测双 链DNA片段是否在长度上表现出多态性,从而寻找 标记.对在长度上没有差异但在序列组成发生变化 的DNA片段(如点突变引起),不能通过一般的凝胶电 泳予以区别.所谓的单链构象多态性(Single Strand Conformational Polymorphism, SSCP)就是在一种不 同的电泳分离技术基础上,从理论上说它能检测出 待分析DNA片段内的基因突变,碱基插入或缺失等 所有的DNA多态性位点