经典分类法 经典分类法是一百多年来进行微生物分类 的传统方法。其特点是人为地选择几种形态 生理生化特征进行分类,并在分类中将表型 特征分为主、次。一般在科以上分类单位以 形态特征、科以下分类单位以形态结合生理 生化特征加以区分
经典分类法 经典分类法是一百多年来进行微生物分类 的传统方法。其特点是人为地选择几种形态 生理生化特征进行分类,并在分类中将表型 特征分为主、次。一般在科以上分类单位以 形态特征、科以下分类单位以形态结合生理 生化特征加以区分
❖ A. 能在 60 o C 以上生长 ❖ B. 细胞大,宽度 1.3~1.8mm . 1. 热微菌属 ( Thermomicrobium ) ❖ B. 细胞小,宽度 0.4~0.8mm ❖ C. 能以葡萄糖为碳源生长 ❖ D. 能在 pH4.5 生长 . 2. 热酸菌属 ( Acidothermus ) ❖ DD. 不能在 pH4.5 生长 . 3. 栖热菌属 ( Thermus ) ❖ CC. 不能以葡萄糖为唯一碳源 . 4. 栖热嗜油菌属 ( 栖热嗜狮 菌属 Thermoleophilum ) ❖ AA. 不能在 60 o C 以上生长
❖ A. 能在 60 o C 以上生长 ❖ B. 细胞大,宽度 1.3~1.8mm . 1. 热微菌属 ( Thermomicrobium ) ❖ B. 细胞小,宽度 0.4~0.8mm ❖ C. 能以葡萄糖为碳源生长 ❖ D. 能在 pH4.5 生长 . 2. 热酸菌属 ( Acidothermus ) ❖ DD. 不能在 pH4.5 生长 . 3. 栖热菌属 ( Thermus ) ❖ CC. 不能以葡萄糖为唯一碳源 . 4. 栖热嗜油菌属 ( 栖热嗜狮 菌属 Thermoleophilum ) ❖ AA. 不能在 60 o C 以上生长
二、现代分类鉴定方法 ❖ 近年来,随着分子生物学的发展和各项新技术 的广泛应用,促使微生物分类鉴定工作有了飞 速发展。对微生物鉴定工作来说,已从经典的 表型特征的鉴定深入到现代的遗传学特性的鉴 定、细胞化学组分的精确分析以及利用电子计 算机进行数值分类研究等新的层次上。 ❖ (一)微生物遗传型的鉴定 ❖ DNA是除少数RNA病毒以外的一切微生物的遗 传信息载体。每一种微生物均有其自己特有的、 稳定的DNA成分和结构,不同微生物间DNA成 分和结构的差异程度代表着它们间新缘关系的 远近。因此,测定每种微生物DNA的若干重要 数据,是微生物鉴定中极其重要的指标:
二、现代分类鉴定方法 ❖ 近年来,随着分子生物学的发展和各项新技术 的广泛应用,促使微生物分类鉴定工作有了飞 速发展。对微生物鉴定工作来说,已从经典的 表型特征的鉴定深入到现代的遗传学特性的鉴 定、细胞化学组分的精确分析以及利用电子计 算机进行数值分类研究等新的层次上。 ❖ (一)微生物遗传型的鉴定 ❖ DNA是除少数RNA病毒以外的一切微生物的遗 传信息载体。每一种微生物均有其自己特有的、 稳定的DNA成分和结构,不同微生物间DNA成 分和结构的差异程度代表着它们间新缘关系的 远近。因此,测定每种微生物DNA的若干重要 数据,是微生物鉴定中极其重要的指标:
1. DNA的碱基组成(G+Cmol%) ❖ 每一个微生物种的 DNA 中 GC mol% 的数值是恒定的,不会随着环境条 件、培养条件等的变化而变化,而且在同一个属不同种之间, DNA 中 GCmol% 的数值不会差异太大,可以某个数值为中心成簇分布,显示同 属微生物种的 GC mol% 范围。 DNA 中 GC mol% 分析主要用于区分细 菌的属和种,因为细菌 DNA 中 GC 含量的变化范围一般在25 %~ 75 %;而放线菌 DNA 中的 GC 比例范围非常窄 (37 %~ 51%) 。一般认为 任何两种微生物在 GC 含量上的差别超过了 10 %,这两种微生物就肯 定不是同一个种。因此可利用 G+C mol %来鉴别各种微生物种属间的亲 缘关系及其远近程度。值得注意的是,亲缘关系相近的菌,其 G+C mol %含量相同或者近似,但G+C mol %相同或近似的细菌,其亲缘关系并 不一定相似,这是因为这一数据还不能反映出碱基对的排列序列,而且 如放线菌的 DNA 的 GC mol% 在 37 ~ 51 之间,企图在这么小的范围 内区分放线菌的几十个属显然是不现实的。要比较两种细菌的 DNA 碱 基对排列序列是否相同,以及相同的程度如何,就需做核酸杂交试验
1. DNA的碱基组成(G+Cmol%) ❖ 每一个微生物种的 DNA 中 GC mol% 的数值是恒定的,不会随着环境条 件、培养条件等的变化而变化,而且在同一个属不同种之间, DNA 中 GCmol% 的数值不会差异太大,可以某个数值为中心成簇分布,显示同 属微生物种的 GC mol% 范围。 DNA 中 GC mol% 分析主要用于区分细 菌的属和种,因为细菌 DNA 中 GC 含量的变化范围一般在25 %~ 75 %;而放线菌 DNA 中的 GC 比例范围非常窄 (37 %~ 51%) 。一般认为 任何两种微生物在 GC 含量上的差别超过了 10 %,这两种微生物就肯 定不是同一个种。因此可利用 G+C mol %来鉴别各种微生物种属间的亲 缘关系及其远近程度。值得注意的是,亲缘关系相近的菌,其 G+C mol %含量相同或者近似,但G+C mol %相同或近似的细菌,其亲缘关系并 不一定相似,这是因为这一数据还不能反映出碱基对的排列序列,而且 如放线菌的 DNA 的 GC mol% 在 37 ~ 51 之间,企图在这么小的范围 内区分放线菌的几十个属显然是不现实的。要比较两种细菌的 DNA 碱 基对排列序列是否相同,以及相同的程度如何,就需做核酸杂交试验
1. DNA的碱基组成(G+Cmol%) ❖ 1)每个生物种都有特定的GC%范围,因此后者可以作为分 类鉴定的指标。细菌的GC%范围为25-75%,变化范围最大, 因此更适合于细菌的分类鉴定。 ❖ 2)GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌作出鉴定, 并可检验表型特征分类的合理性,从分子水平上判断物种的 亲缘关系。 ❖ 3)使用原则: ❖ G+C含量的比较主要用于分类鉴定中的否定每一种生物都有 一定的碱基组成,亲缘关系近的生物,它们应该具有相似的 G+C含量,若不同生物之间G+C含量差别大表明它们关系远。 但具有相似G+C含量的生物并不一定表明它们之间具有近的 亲缘关系
1. DNA的碱基组成(G+Cmol%) ❖ 1)每个生物种都有特定的GC%范围,因此后者可以作为分 类鉴定的指标。细菌的GC%范围为25-75%,变化范围最大, 因此更适合于细菌的分类鉴定。 ❖ 2)GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌作出鉴定, 并可检验表型特征分类的合理性,从分子水平上判断物种的 亲缘关系。 ❖ 3)使用原则: ❖ G+C含量的比较主要用于分类鉴定中的否定每一种生物都有 一定的碱基组成,亲缘关系近的生物,它们应该具有相似的 G+C含量,若不同生物之间G+C含量差别大表明它们关系远。 但具有相似G+C含量的生物并不一定表明它们之间具有近的 亲缘关系