基因表达数据库: 基因表达库(GEO); 斯坦福微阵列数据库(SMD) ArrayEXpress; CGED GXD odyMMap等 16/131
基因表达数据库: • 基因表达库(GEO); • 斯坦福微阵列数据库(SMD); • ArrayExpress; • CGED; • GXD; • BodyMap 等。 16 /131
人类基因突变及疾病相关数据库: 人类基因变异数据库(HMGD)、人类遗传双等位基因序 列数据库( HGBASE)、人类孟德尔遗传在线(OM|M) 国际单体型计划( HapMap)、人类单核苷酸多态性数据 库( db snP)、肿瘤基因数据库(TGDB)、疾病关联数 据库(GAD)、癌症基因数据库(CGAP)、人类表观遗 传数据库(HEP)、人类DNA甲基化与癌症数据库 ( MethylCancer)等。 17/131
人类基因突变及疾病相关数据库: • 人类基因变异数据库(HMGD)、人类遗传双等位基因序 列数据库(HGBASE)、人类孟德尔遗传在线(OMIM)、 国际单体型计划(HapMap)、人类单核苷酸多态性数据 库(dbSNP)、肿瘤基因数据库(TGDB)、疾病关联数 据库(GAD)、癌症基因数据库(CGAP)、人类表观遗 传数据库(HEP)、人类DNA甲基化与癌症数据库 (MethylCancer)等。 17 /131
蛋白质序列数据库 随着分子生物学的发展,人们获得了越来越多关于蛋白质 序列、结构和功能的信息。世界各国的生物学家和计算机 科学家合作利用这些信息构建了蛋白质序列数据库、蛋白 质三维结构数据库、蛋白质组数据库(二维凝胶电泳数据 库)、信号传导及蛋白质-蛋白质相互作用相关数据库、 DNA和蛋白质相互作用数据库等蛋白质相关数据库 18/131
蛋白质序列数据库 • 随着分子生物学的发展,人们获得了越来越多关于蛋白质 序列、结构和功能的信息。世界各国的生物学家和计算机 科学家合作利用这些信息构建了蛋白质序列数据库、蛋白 质三维结构数据库、蛋白质组数据库(二维凝胶电泳数据 库)、信号传导及蛋白质-蛋白质相互作用相关数据库、 DNA和蛋白质相互作用数据库等蛋白质相关数据库。 18 /131
常用的蛋白质序列数据库 PIR MIPS Swiss-Prot Uni Prot 19/131
常用的蛋白质序列数据库: • PIR • MIPS • Swiss-Prot • UniProt 19 /131
蛋白质功能、结构域和蛋白质家族 有关的数据库: PROSITE Inter Pro Pfam ProDom SMART等 20/131
蛋白质功能、结构域和蛋白质家族 有关的数据库: • PROSITE • InterPro • Pfam • ProDom • SMART 等 20 /131