药物生物信息学 序列比对(1) 2021/1/26
2021/1/26 1 药物生物信息学 序列比对（1）
练习: 设有两个序列: GACGGATTAG, GATCGGAATA Alignment. GACGGATTAG GA- CGGATTAG GATCGGAATA GATCGGAATA 2021/1/26
2021/1/26 2 练习： Alignment: GACGGATTAG GATCGGAATA 设有两个序列： GACGGATTAG，GATCGGAATA GA- CGGATTAG GATCGGAATA -
序列比对的任务与目的 ●序列比对的根本任务: 发现序列之间的相似性 辨别序列之间的差异 ●目的: 相似序列→相似的结构,相似的功能 判别序列之间的同源性 推测序列之间的进化关系 2021/1/26
2021/1/26 3 序列比对的任务与目的 ⚫ 序列比对的根本任务： –发现序列之间的相似性 –辨别序列之间的差异 ⚫ 目的： 相似序列 → 相似的结构，相似的功能 判别序列之间的同源性 推测序列之间的进化关系
本章内容 序列的相似性 ●二重序列比对 多重序列比对 DNA片断组装 2021/1/26
2021/1/26 4 本章内容 ⚫ 序列的相似性 ⚫ 二重序列比对 ⚫ 多重序列比对 ⚫ DNA片断组装
第一节序列的相似性 字母表和序列 编辑距离 ●矩阵作图法 序列的两两比对 ●打分矩阵 2021/1/26
2021/1/26 5 第一节 序列的相似性 ⚫ 字母表和序列 ⚫ 编辑距离 ⚫ 矩阵作图法 ⚫ 序列的两两比对 ⚫ 打分矩阵