Ureaplasma Bacillus subtilis Drosophila Rickettsia prowazekii Helicobacter urea山yticum挖愿愿原体枯草芽孢杆菌 melanogaster普氏立克次体 pylori幽门螺杆离 Buchnerasp. Escherichia human Thermotoga APS Arabidopsis co心大肠杆菌 拟南芥 maritima海栖热袍菌 Thermoplasma Caenorhabitis mouse rat Borrelia burgorferi acidophilum elegans 伯氏疏螺旋体 Plasmodium Borrelia Aquifex Neisseria Mycobacteriu falciparum恶性 burgorferi aeolicus嗜热菌 meningitidis脑膜 m tuberculosis 20克627 炎奈瑟菌 结核枉菌
human Thermotoga maritima海栖热袍菌 Escherichia coli大肠杆菌 Buchnerasp. APS Rickettsia prowazekii 普氏立克次体 Ureaplasma urealyticum溶脲脲原体 Bacillus subtilis 枯草芽孢杆菌 Drosophila melanogaster Thermoplasma acidophilum Plasmodium falciparum恶性 疟原虫 Helicobacter pylori幽门螺杆菌 mouse Caenorhabitis elegans rat Borrelia burgorferi 伯氏疏螺旋体 Borrelia burgorferi Aquifex aeolicus嗜热菌 Neisseria meningitidis脑膜 炎奈瑟菌 Mycobacteriu m tuberculosis 结核杆菌 Arabidopsis 拟南芥 2025/5/27
这些大型国际合作项目不仅产生出巨 大的数据量，而且对数据处理工作也提出 了前所未有的要求。人们已经充分认识到， 如果不能及时分析和有效利用这些信息， 那么这些耗费巨资所获得的数据也无异于 增加了一堆垃圾。 数理与生物工程学院 2025/5/27 BIOINFORMATICS
这些大型国际合作项目不仅产生出巨 大的数据量，而且对数据处理工作也提出 了前所未有的要求。人们已经充分认识到， 如果不能及时分析和有效利用这些信息， 那么这些耗费巨资所获得的数据也无异于 增加了一堆垃圾。 2025/5/27 BIOINFORMATICS 7 数 理 与 生 物 工 程 学 院
1.1.1生物信息学基本概念 广义的生物信息学是指以核酸蛋白质等生物 大分子为主要研究对象，以信息、数理、计算机 科学为主要研究手段，以计算机网络为主要研究 环境，以计算机软件为主要研究工具，对序列数 据进行存储、管理、注释、加工，对各种数据库 进行查询、搜索、比较、分析，构建各种类型的 专用数据库信息系统，研究开发面向生物学家的 程 新一代计算机软件。 学 院 2025/5/27 BIOINFORMATICS
广义的生物信息学是指以核酸蛋白质等生物 大分子为主要研究对象，以信息、数理、计算机 科学为主要研究手段，以计算机网络为主要研究 环境，以计算机软件为主要研究工具，对序列数 据进行存储、管理、注释、加工，对各种数据库 进行查询、搜索、比较、分析，构建各种类型的 专用数据库信息系统，研究开发面向生物学家的 新一代计算机软件。 2025/5/27 1.1.1 生物信息学基本概念 BIOINFORMATICS 8 数 理 与 生 物 工 程 学 院
并利用数理统计、模式识别、动态规划、密码 解读、语意解析、信令传递、神经网络、遗传算法 以及隐马氏模型等各种方法，对序列、结构数据进 行定性和定量分析，从中获取基因编码、基因调控、 序列结构-功能关系等理性知识，阐明细胞、器官 数 理 和个体的发生、发育、病变、衰亡的基本规律和时 空联系，探索生命起源、生物进化、生命本质等重 程 大理论问题，最终建立“生物学周期表”。 2025/5/27 BIOINFORMATICS 9
并利用数理统计、模式识别、动态规划、密码 解读、语意解析、信令传递、神经网络、遗传算法 以及隐马氏模型等各种方法，对序列、结构数据进 行定性和定量分析，从中获取基因编码、基因调控、 序列-结构-功能关系等理性知识，阐明细胞、器官 和个体的发生、发育、病变、衰亡的基本规律和时 空联系，探索生命起源、生物进化、生命本质等重 大理论问题，最终建立“生物学周期表”。 2025/5/27 BIOINFORMATICS 9 数 理 与 生 物 工 程 学 院
1.1.2生物信息学的研究目标和任 揭示生物分子数据隐含的生物学信息是 其长远目标和根本任务。 目前生物信息学的主要任务： 第一是收集和管理生物分子数据。 第二是进行数据处理和分析。 数理与生物 第三个方面是开发分析工具和实用软件。 程学院 2025/5/27 BIOINFORMATICS 10
揭示生物分子数据隐含的生物学信息是 其长远目标和根本任务。 目前生物信息学的主要任务： 第一是收集和管理生物分子数据 。 第二是进行数据处理和分析。 第三个方面是开发分析工具和实用软件。 2025/5/27 1.1.2 生物信息学的研究目标和任务 BIOINFORMATICS 10 数 理 与 生 物 工 程 学 院