Nucleus DNA Cytoplasm TRANSCRIPTION Allel RNA Codon TRANSLATION Met Ala P Amino acid 引自 Neil Campbel著 Biology第4版,1996
引自Neil Campbell著Biology第4版，1996
start Genomic dNa DNA replication DNA transcribe RNA Pol lI+ Pre-mRNA splice uru2U4UsURNP RNA RNA mRNA 5’-UTR 3-UTR Translation translate AA seq protein primary seq) elong. factors Protein Protein fold chaperonin 中心法则
5’-UTR 3’-UTR transcribe Genomic DNA Pre-mRNA splice mRNA translate AA seq ( protein primary seq ) fold Protein fold start stop 5’ 3’ RNA Pol II +… splicesome u1u2u4u5u6RNP ribsome init. + elong. factors term. chaperonine 中心法则
模式生物 噬菌体( Bacteriophage: lambda,T4,T7) 病毒( Viruses:SV40,HIV) 大肠杆菌( Escherichia coli 酵母( Saccharomyces cerevisiae, yeast budding) 线虫 Caenorhabitidis elegans, nematode,worm) 果蝇( Drosophila melanogaster, fruitfly) 拟南芥( Arabidopsis thaliana) 水稻( Oryza sativa,rce) 非洲爪蟾( Xenopus lavine, African frog) 斑马鱼( Danio rerio, Zebra fish) 小鼠( Mus musculus, mouse) 智人( Homo sapiens)
§ 噬菌体(Bacteriophage: lambda, T4, T7) § 病毒(Viruses: SV40, HIV) § 大肠杆菌(Escherichia coli) § 酵母(Saccharomyces cerevisiae , yeast budding) § 线虫(Caenorhabitidis elegans, nematode, worm) § 果蝇(Drosophila melanogaster, fruitfly) § 拟南芥(Arabidopsis thaliana) § 水稻(Oryza sativa, rice) § 非洲爪蟾(Xenopus laviae, African frog) § 斑马鱼(Danio rerio, Zebra fish) § 小鼠(Mus musculus, mouse) § 智人(Homo sapiens)
生物信息的开发和应用 以蛋白质核酸等生物大分子为主要研究对象 以信息、数理、计算机科学为主要研究手段 以计算机网络为主要研究环境 以计算机软件为主要研究工具 对序列数据进行存储、管理、注释、加工 ◆对各种数据库进行查询、搜索、比较、分析 构建各种类型的专用数据库信息系统 研究开发面向生物学家的新一代计算机软件
v 以蛋白质核酸等生物大分子为主要研究对象 v 以信息、数理、计算机科学为主要研究手段 v 以计算机网络为主要研究环境 v 以计算机软件为主要研究工具 v 对序列数据进行存储、管理、注释、加工 v 对各种数据库进行查询、搜索、比较、分析 v 构建各种类型的专用数据库信息系统 v 研究开发面向生物学家的新一代计算机软件
生物信息学研究方法和目标 利用数理统计、模式识别、动态规划、密码解 读、语意解析、信号传递、神经网络、遗传算 法以及隐马氏模型等各种方法对序列、结构数 据进行定性和定量分析,从中获取基因编码 基因调控、序列-结构-功能关系等理性知识 阐明细胞、器官和个体的发生、发育、病变 衰亡的基本规律和时空联系 探索生命起源、生物进化、生命本质等重大理 论问题,最终建立“生物学周期表
v 利用数理统计、模式识别、动态规划、密码解 读、语意解析、信号传递、神经网络、遗传算 法以及隐马氏模型等各种方法对序列、结构数 据进行定性和定量分析，从中获取基因编码、 基因调控、序列-结构-功能关系等理性知识 v 阐明细胞、器官和个体的发生、发育、病变、 衰亡的基本规律和时空联系 v 探索生命起源、生物进化、生命本质等重大理 论问题，最终建立“生物学周期表