目前,这3个数据库已建立数据交换协议,每日同 时更新核酸序列资料。对用户而言,在任意一个数据 库中查询数据(或向任意一个数据库投送数据)基本 上是等价的。3个组织相互合作,各数据库中的数据基 本一致,仅在数据格式上有所差别,对于特定的查询, 3个数据库的响应结果一样。 理与生物工程学 2025/5/27 BIOINFORMATICS
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 21 目前,这3个数据库已建立数据交换协议,每日同 时更新核酸序列资料。对用户而言,在任意一个数据 库中查询数据(或向任意一个数据库投送数据)基本 上是等价的。3个组织相互合作,各数据库中的数据基 本一致,仅在数据格式上有所差别,对于特定的查询, 3个数据库的响应结果一样
这3个数据库是综合性的DNA和RNA序列数据库, 其数据来源于众多的研究机构和核酸测序小组,来 源于科学文献。用户可以通过各种方式将核酸序列 数据提交给这3个数据库系统。数据库中的每条记录 代表一个单独、连续、附有注释的DNA或RNA片段。 这里,我们以GenBank为例,介绍核苷酸序列数据库。 理与生物工程学院 2025/5/27 BIOINFORMATICS 22
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 22 这3个数据库是综合性的DNA和RNA序列数据库, 其数据来源于众多的研究机构和核酸测序小组,来 源于科学文献。用户可以通过各种方式将核酸序列 数据提交给这3个数据库系统。数据库中的每条记录 代表一个单独、连续、附有注释的DNA或RNA片段。 这里,我们以GenBank为例,介绍核苷酸序列数据库
3.2.1.1 GenBank的建立与发展 GenBank的全称为“GenBank Genetic Sequence Data Bank”,由美国卫生和人类服务部(U.S. Department of Health&Human Services)注册。该 项目在20世纪80年代初由美国Intelli Genetics(IG) 公司和LosA1amos国家实验室(LANL)共同资助及组 织实施。 理与生物工程学 2025/5/27 BIOINFORMATICS 23
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 23 3.2.1.1 GenBank的建立与发展 GenBank的全称为“GenBank Genetic Sequence Data Bank” , 由 美 国 卫 生 和 人 类 服 务 部 (U.S. Department of Health&Human Services)注册。该 项目在20世纪80年代初由美国Intelli Genetics(IG) 公司和Los Alamos国家实验室(LANL)共同资助及组 织实施
随后得到美国国立卫生研究院(IH)、国家医学 实验室(NLMW、农业部(USDA)、国家科学基金会(NFS) 及能源部(DOE)等机构的持续资助。目前,GenBank由 美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)管理运行。图3 5为NCBI-GenBank的主页,用户可以直接通过该页面 检索GenBank数据库。 数理与生物工程学院 2025/5/27 BIOINFORMATICS 24
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 24 随后得到美国国立卫生研究院(NIH)、国家医学 实验室(NLM)、农业部(USDA)、国家科学基金会(NFS) 及能源部(DOE)等机构的持续资助。目前,GenBank由 美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)管理运行。图3- 5为NCBI-GenBank的主页,用户可以直接通过该页面 检索GenBank数据库
NCBI National Center for Biotechnology Information National Library of Medicine National Institutes of Health PubMed Entrez BLAST OMIM B00k8 TaxBrowser Structure Search Entrez for Go Site Map What does NCBI do? Hot Spots Alphabetical List Resource Guide Established in 1988 as a national resource for Clusters of orthologous groups About NCBI molecular biology information,NCBI creates An introduction for public databases,conducts research in researchers, computational biology,develops software Coffee Break. Genes Disease, educators and the tools for analyzing genome data,and public disseminates biomedical information-all for NCBI Handbook the better understanding of molecular GenBank ◆Electronic PCR processes affecting human health and Sequence disease.More. submission support Entrez Home and software HomoloGene Entrez Tools Literature databases HomoloG ene,a system for automated detection of Gene expression homologs among eukaryotic gene sets,has been added PubMed,OMIM to the Entrez retrieval system omnibus Books,and PubMed Central Human genome resources Entrez Gene Molecular You can now use Entrez to search for LocusLink databases information contered on the concopt of a Sequences, aene,and connect to m any sources of related information both within and outside NCBI. Malaria genetics 图3-5NCBI主页
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