PCR相关技术:1.增效PCR(boosterPCR)当扩增少于1000拷贝的模板DNA时会遇到两个问题:一是形成引物二聚体,一是非特异扩增,消耗了引物和酶,而特异扩增片段产量降低。对于这种情况,可设置二步PCR,先用较低浓度的引物进行初级PCR,此时由于引物少,形成引物二聚体的可能减少,但它并不影响靶序列的扩增只是由于引物少产量不高。约经15~20个循环后补充产物量,以初级PCR产物为模板进行扩增靶序列的产量将相应增加
6 PCR相关技术: 1.增效PCR(booster PCR) 当扩增少于1000拷贝的模板DNA时会遇到两个问 题:一是形成引物二聚体,一是非特异扩增,消 耗了引物和酶,而特异扩增片段产量降低。对于 这种情况,可设置二步PCR,先用较低浓度的引 物进行初级PCR,此时由于引物少,形成引物二 聚体的可能减少,但它并不影响靶序列的扩增, 只是由于引物少产量不高。约经15~20个循环后 补充产物量,以初级PCR产物为模板进行扩增, 靶序列的产量将相应增加
2.巢式PCR(nest PCR)此时也是进行二步PCR,与上面不同的是第二级PCR需另行设置反应体系,并应用另外的PCR引物,此时引物的位置位于初级PCR引物的内侧,用初级PCR产物做模板进行第二步PCR,这样只有初级PCR中特异的扩增片段才能被二级引物扩增除了达到增效PCR同样的目的外,还提高了最终产物的特异性
7 2. 巢式PCR(nest PCR) 此时也是进行二步PCR,与上面不同的是, 第二级PCR需另行设置反应体系,并应用另 外的PCR引物,此时引物的位置位于初级 PCR引物的内侧,用初级PCR产物做模板, 进行第二步PCR,这样只有初级PCR中特异 的扩增片段才能被二级引物扩增。 除了达到增效PCR同样的目的外,还提高了 最终产物的特异性
3、多重PCR在同一PCR体系中加入数对PCR引物,如果这些引物的退火温度相近,并且所覆盖的区域不重叠,这样的反应体系可同时扩增多个DNA片段。多重PCR常用来检测同一基因的多个外显子的缺失,或在检测缺失设置内对照
8 ⚫ 在同一PCR体系中加入数对PCR引物,如果 这些引物的退火温度相近,并且所覆盖的 区域不重叠,这样的反应体系可同时扩增 多个DNA片段。 ⚫ 多重PCR常用来检测同一基因的多个外显子 的缺失,或在检测缺失设置内对照。 3、多重PCR
4.RT-PCRRT-PCR是以mRNA为模板,经逆转录酶作用合成cDNA。使微量的mRNA(pg水平)迅速扩增(达ng~ug水平),大大提高mRNA的检出灵敏度。应用于基因表达与调控的研究
9 4.RT-PCR ⚫ RT-PCR是以mRNA为模板,经逆转录酶作 用合成cDNA。使微量的mRNA(pg水平) 迅速扩增(达ng~ug水平),大大提高 mRNA的检出灵敏度。应用于基因表达与 调控的研究