PCR扩增法获得目的基因策略:PCR产物克隆到载体中。普通PCR(PolymeraseChainReaction)反转录PCR(RT-PCR)RACE (Rapid Amplification of cDNAEnd)
二 PCR扩增法获得目的基因 • 策略:PCR产物克隆到载体中。 • 普通PCR(Polymerase Chain Reaction) • 反转录PCR(RT-PCR) • RACE(Rapid Amplification of cDNA End)
PCR扩增法获得自的基达(1)目的基因的直接克隆■适当的引物,PCR基因扩增法可以产生μg级的特异的靶DNA片段,达到这种数量级的基因组DNA可以直接克隆到相应的载体(如质粒或者M13载体,如pMD18-T) 中。(2)CDNA的克隆■利用PCR技术,只需增加一步逆转录反应,便可从少数的mRNA构建cDNA文库。以mRNA为模板,以oligo(dT)为引物,在依赖于RNA的DNA聚合酶催化下体外合成cDNA第一链之后,可通过PCR扩增此链
二 PCR扩增法获得目的基因 n (1)目的基因的直接克隆 n 适当的引物,PCR基因扩增法可以产生μg级的特异的靶DNA片段,达到这种 数量级的基因组DNA可以直接克隆到相应的载体(如质粒或者M13载体,如 pMD18-T)中。 n (2)cDNA的克隆 n 利用PCR技术,只需增加一步逆转录反应,便可从少数的mRNA构建cDNA 文库。以mRNA为模板,以oligo(dT)为引物,在依赖于RNA的DNA聚合 酶催化下体外合成cDNA第一链之后,可通过PCR扩增此链
PCR扩增法获得目的基因一(1)目的基因的直接克隆pMD18-T&pMD19-TVector的结构pMD18-T&pMD19-TEcoRVT-Cloning SiteVector(2,692 bp)pMD18-TVectorBcaBESTTMSequencing PrimerRVM(GAGCGGATAACAATTTCACACAGGXmalHinc IISmalAccl Ss0B3871laezEcoRISacIKpnlSamHI XbalEcoRVSallPstlSphHindGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGACCATGATTACGAATTCGAGCTCGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGATATCGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTGGCACTGGCCGTCGTTTTACAACGTCGTGACTGGGAAAACCCTGGCGDigested by EcoR VCAGCACTGACCCTTTTGGGACCGCBcaBESTrSequencingPrimerM13-47...tetagagattatcgtcgacc(T-Cloning Site)pMD19-TVector--agatctctaTtagcagctgg
二 PCR扩增法获得目的基因 n (1)目的基因的直接克隆
PCR扩增法获得自的基因(2)cDNA的克隆定义:以提取的细胞总RNA或纯化的mRNA为模板,反转录获得cDNA,以基因特异性引物扩增获得特异基因的片段SSSSSSmRNA3CDNAB3IIS多宴
二 PCR扩增法获得目的基因 n (2)cDNA的克隆 n 定义:以提取的细胞总RNA或纯化的mRNA为模板,反转录获得cDNA,以 基因特异性引物扩增获得特异基因的片段
PCR扩增法获得自的基因(2)cDNA的克隆总RNA提取:防止RNA的降解和断裂,防止DNA的污染。两步法:先合成cDNA第一链,再进行PCR扩增。合成cDNA引物的选择:(1)随机六聚体引物:非特异,PCR引物赋予特异性,合成的cDNA中96%来源于rRNA。(2)Oligo(dT):是一种对mRNA特异的方法。(3)特异性引物:引物与目标RNA互补,PCR扩增特异性高
二 PCR扩增法获得目的基因 n (2)cDNA的克隆 • 总RNA提取: 防止RNA的降解和断裂,防止DNA的污染。 • 两步法:先合成cDNA第一链,再进行PCR扩增。 • 合成cDNA引物的选择:(1) 随机六聚体引物:非特异,PCR引物赋予特 异性,合成的cDNA中96%来源于rRNA。 • (2) Oligo(dT):是一种对mRNA特异的方法。 • (3)特异性引物:引物与目标RNA互补,PCR扩增特异性高