图6-1示出6个分类群(A-F)进行不同划分所 产生的单系、并系和复系类群的例子。图6-1(a) 中单系类群为:{A,B},{E,D,F}、{C,D,E,F }、{A,B,C,D,E,F 图6-1(b)中并系类群为:{C,D,E}、{B,C,D, E,F}等 图6-1(c)中复系类群为:{B,D}、{B,D,E,F} 数理与生物工程学 2025/5/27 BIOINFORMATICS 26
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 26 图6-1示出6个分类群(A-F)进行不同划分所 产生的单系、并系和复系类群的例子。图6-1(a) 中单系类群为:{A,B},{E,D,F}、{C,D,E,F }、{A,B,C,D,E,F} 图6-1 (b)中并系类群为:{C, D,E}、{B,C,D, E, F}等 图6-1 (c)中复系类群为:{B,D}、{B,D,E,F}
A B D E F A B C D E】 ●● B (c) 图6-1单系类群(a)、并系类群(b)、复系类群(c)
图6-1 单系类群(a)、并系类群(b)、复系类群(c)
图6-2示出了内类群、外类群和姊妹群的例子。 图中G1={A,B,C}和G2={S,G1}可视为内类群; O1,O2为G2的外类群;S为G1的姊妹群 G2 B G 01 图6-2内类群、外类群和姊妹群
图6-2 示出了内类群、外类群和姊妹群的例子。 图中G1={A,B,C}和G2={S,G1}可视为内类群; O1,O2为G2的外类群;S为G1的姊妹群 图6-2 内类群、外类群和姊妹群
6.1.2.2有根树和无根树 系统树是表达类群(或序列)间系统发育关 系的一种树状图,可划分为以下几种类型。以 外类群作为树根的系统树称为有根树,没有外 类群作为树根的系统树称为无根树。有根树中 有一个惟一的根节点,代表所有其他节点的共 同祖先,这样的树能够反映进化层次,从根节 点历经进化到任何其他节点只有惟一的路径。 无根树没有层次结构,无根树只说明了节点之 数理与生 间的关系,没有关于进化发生方向的信息。 工程学院 2025/5/27 BIOINFORMATICS 29
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 29 6.1.2.2 有根树和无根树 系统树是表达类群(或序列)间系统发育关 系的一种树状图,可划分为以下几种类型。以 外类群作为树根的系统树称为有根树,没有外 类群作为树根的系统树称为无根树。有根树中 有一个惟一的根节点,代表所有其他节点的共 同祖先,这样的树能够反映进化层次,从根节 点历经进化到任何其他节点只有惟一的路径。 无根树没有层次结构,无根树只说明了节点之 间的关系,没有关于进化发生方向的信息
当分类单位数目为n(n>2)时,全部可能的有根 树(二歧分支)的数目为: 当心3时,无根树(二歧分支)的数目为: NR=(2n-3)/[2”-2(n-2)川 (6-1) N=(2n-5)/[2"-3(n-3)] (6-2) 理与生物 工程 院 2025/5/27 BIOINFORMATICS 30
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 30 2 (2 3)! [2 ( 2)!] n N n n R − = − − 3 (2 5)! [2 ( 3)!] n N n n U − = − − 当分类单位数目为n (n>2)时,全部可能的有根 树(二歧分支)的数目为: 当n≥3时,无根树(二歧分支)的数目为: (6-2) (6-1)