单细菌基因组测序技术——Microbe-seqAEncapsulationLysiswhole-genomeAmplification》将单个细菌封装在含有裂解试剂的TagmentationBarcodingPooling油包水中，液滴在微流控装置中与其他试剂进行一系列合并步骤，以执行基因组扩增Adapters227GenomesOBeadsBarcodescB1001007575SSeS. aureus. 2.8 Mb5050oB. subtilis: 4.3 MbK.pneumoniae: 5.4 Mb2525E.coll. 5.1Mb202040608010010304050Purity (%)NumberofSAGsZheng etal.,Science, 2022
Zheng et al., Science, 2022 单细菌基因组测序技术——Microbe-seq Ø 将单个细菌封装在含有裂解试剂的 油包水中，液滴在微流控装置中与 其他试剂进行一系列合并步骤，以 执行基因组扩增
单细菌转录组测序技术PETRI-seqMicroSPLiTABx10°Bacterial cells (fixed)1217B.subols (45.4%)suno wn ieo, sipgns##R话你1443 E, con (53.8%)22 Mixed (0.8%)HTPermeabilization andcell wall digestion两种技术手段原理类ai0似，均是通过Split-0510152025303540x10E.coitotalUMIcountsmRNA enrichmentMINA-MAAcTRNAmRNArRN/pool的方式实现单个300040000Three rounds of30000细菌细胞的标记，来split-pool barcoding200001000完成原核细胞的单细10000ECBSBSEC胞RNA测序。+DUniquelybarcodedcDNAUI1-8.S.H111*2-B.S.Lysisand libraryprep3-ECHS4-E.C.BCBCi+5-E.C.CSLirkoBatPrereCoet.UsBlattmanetal.,Nat.Microbiol.,2020Kuchina et al.,Science, 2021
MicroSPLiT Kuchina et al., Science, 2021 Blattman et al., Nat. Microbiol., 2020 PETRI-seq 单细菌转录组测序技术 Ø 两种技术手段原理类 似，均是通过Split- pool的方式实现单个 细菌细胞的标记，来 完成原核细胞的单细 胞RNA测序