低通量单细胞获取技术有限稀释法LCMLimitingDilutionFACSoo流式细胞分选激光显微切割O0显微操作法MicromanipulatorMicrofluidicsnula操作复杂测序费用昂贵单细胞测序技术的主要分选方法整体分选细胞通量较小Andre,G.etal.Int.J.Mol.Sci.2015(详见技术原理将在第2-3次课介绍
低通量单细胞获取技术 (详见技术原理将在第2-3次课介绍)
高通量单细胞获取技术微流控交叉(十字)系统RTandEXONItreatmentLoad cellCotllecsuspensionPCRPickout10x.RarorsrGotl BeadeFnzymPick out celldoublets细胞分离系统工作原理LibrarySingte Celt"preparationLoadbeadBeads:使用350万种16bpbarcodesuspensionBarcode技术WashPestdTNSequencingandAnalysisBDbeads1MagnetCellExpressionHeterogeneityVariationImage,addlysisbuffer..Gene ModuleBeadsMicrowell-seq微流控系统UMI:Unique Molecular Identifiers(详见技术原理将在第2-3次课介绍
高通量单细胞获取技术 微流控系统 Microwell-seq Barcode技术 (详见技术原理将在第2-3次课介绍) UMI: Unique Molecular Identifiers
3、单细胞数据科学数据特征数据分析流程或挖掘途径
3、单细胞数据科学 • 数据特征 • 数据分析流程或挖掘途径
普通转录组实验设计和数据结构RNA-SEQ)处理#1处理#2处理#3重复样品#1样品#2样品#3样品#1样品#2样品#3样品#1样品#2样品#3基因#1基因#2基因#n*n=基因组注释基因数量(一般包括几万个基因)
普通转录组实验设计和数据结构( RNA-SEQ) 处理#1 处理#2 处理#3 \重复 样品#1 样品#2 样品#3 样品#1 样品#2 样品#3 样品#1 样品#2 样品#3 基因#1 基因#2 。 基因#n *n = 基因组注释基因数量(一般包括几万个基因)
单细胞转录组数据结构基因\单细胞细胞#1细胞#2细胞#m0C基因#1基因#20oO基因#n*n=基因组注释基因数量(一般包括几万个基因):m=1000几万个细胞(几十万个)
单细胞转录组数据结构 基因\单细胞 细胞#1 细胞#2 。 细胞#m 基因#1 基因#2 。 基因#n *n = 基因组注释基因数量(一般包括几万个基因);m = 1000~几万个细胞(几十万个)