图8-5构建网络的方法示例
图8-5 构建网络的方法示例
网络从结构上可分为指数式网络和自由标度 网络。指数式网络是均匀的，大部分节点有近似 相同的连接数。自由标度网络是不均匀的，大多 数节点只有一个或两个连接，但少数节点有大量 连接，从而保证系统是全部连通的。 数理与生物工程学院 2025/5/27 BIOINFORMATICS 17
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 17 网络从结构上可分为指数式网络和自由标度 网络。指数式网络是均匀的，大部分节点有近似 相同的连接数。自由标度网络是不均匀的，大多 数节点只有一个或两个连接，但少数节点有大量 连接，从而保证系统是全部连通的
Exponential Scale-free 图8-6指数式网络和自由标度网络的差异
图8-6 指数式网络和自由标度网络的差异
8.2.4后基因组生物信息学的重大挑战 后基因组生物信息学是生物信息学中具有极 大挑战性的领域。给定一个生物的全基因组，剩 下的问题就是如何在计算机上重构这个生物体的 功能体系。这个问题包括对所有组成部分（基因 和其它生物分子)之间连线（相互作用）的预测 。传统的看法是基因组是生命的蓝图，包含了构 建生物体的全部信息。 数理与生物工程学 2025/5/27 BIOINFORMATICS 19
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 19 8.2.4 后基因组生物信息学的重大挑战 后基因组生物信息学是生物信息学中具有极 大挑战性的领域。给定一个生物的全基因组，剩 下的问题就是如何在计算机上重构这个生物体的 功能体系。这个问题包括对所有组成部分（基因 和其它生物分子）之间连线（相互作用）的预测 。传统的看法是基因组是生命的蓝图，包含了构 建生物体的全部信息
但现在更加合理的看法是基因组只是细胞中 分子之间相互作用的整个网络的一部分。基因组 只是细胞指令的大仓库，相互作用网络本身才是 那个所谓的指令系统，这个系统遵循固有程序引 导发育过程，并产生生殖细胞。 后基因组生物信息学是以对一系列生物学知 识的综合为特征的。是在网络观点下、在分子网 络层次上研究和理解生命的基本规律。 理与生 工程学院 2025/5/27 BIOINFORMATICS 20
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 20 但现在更加合理的看法是基因组只是细胞中 分子之间相互作用的整个网络的一部分。基因组 只是细胞指令的大仓库，相互作用网络本身才是 那个所谓的指令系统，这个系统遵循固有程序引 导发育过程，并产生生殖细胞。 后基因组生物信息学是以对一系列生物学知 识的综合为特征的。是在网络观点下、在分子网 络层次上研究和理解生命的基本规律