重叠群( contig):指相互间存在重叠顺序的一组 克隆。 克隆重叠群法( clone contig):基因组被打断为 许多片段,建立重叠群,对每一片段进行鸟枪法测 序,一旦测序完成,便可将其定位在基因组图上的 正确位置。 直接鸟枪法( directed shotgun):首先进行全基 因组鸟枪法测序,再以基因组图的分子标记为起点 将鸟枪法DNA片段进行组装
重叠群(contig):指相互间存在重叠顺序的一组 克隆。 克隆重叠群法(clone contig):基因组被打断为 许多片段,建立重叠群,对每一片段进行鸟枪法测 序,一旦测序完成,便可将其定位在基因组图上的 正确位置。 直接鸟枪法(directed shotgun):首先进行全基 因组鸟枪法测序,再以基因组图的分子标记为起点 将鸟枪法DNA片段进行组装
标记 A BC DE F G H 已作图的DNA片段一 全基因组 B 鸟枪法 B DE H 重叠群法 A BC DE F G H 直接鸟枪法
标记 A B A B D E H A B C D E F G H A B C D E F G H 已作图的DNA片段 全基因组 鸟枪法 重叠群法 直接鸟枪法
遗传图与物理图 遗传作图( Genetic mapping).用遗传学分析方 法将基因或其它DNA顺序标定在染色体上构建连 锁图。这一方法包括杂交实验,家系分析。遗传图 距单位为厘摩(cM),每单位厘摩定义为1%交换率。 物理作图( Physical mapping).用分子生物学 技术直接将DNA分子标记、基因或克隆标定在基 因组实际位置。物理图的距离依作图方法而异,如 辐射杂种( radiation hybrid)作图的计算单位为 厘镭(cR),限制性片段作图与克隆作图的图距为 DNA的分子长度,即碱基对
遗传图与物理图 遗传图与物理图 遗传作图(Genetic mapping ) 采用遗传学分析方 法将基因或其 它DNA顺序标定在染色体上构建连 锁图。这一方法包括杂交实验,家系分析。遗传图 距单位为厘摩 ( cM), 每单位厘摩定义为1%交换率。 物理作图(Physical mapping ) 采用分子生物学 技术直接 将DNA分子标记、基因或克隆标定在基 因组实际位置。物理图的距离依作图方法而异,如 辐射杂种 (radiation hybrid)作图的计算单位为 厘镭(c R ) , 限制性片段作图与克隆作图的图距为 DNA的分子长度,即碱基对
22遗传作图的标记 和AR化命 Setting flags on the genome
2.2 遗传作图的标记 遗传作图的标记 Setting flags on the genome
形态标记:指那些能够明确显示遗传多态性的 外观性状。如果蝇眼睛的颜色、植株的高矮等。 广义的形态标记那些借助简单测试即可识别的 某些形状如生理特性、抗病虫性等。 个遗传形状必须以两种表型( phenotype) 存在才能用于遗传学分析,每种表型是由相应 基因的不同等位基因( allele)所决定的
形态标记:指那些能够明确显示遗传多态性的 外观性状。如果蝇眼睛的颜色、植株的高矮等。 广义的形态标记那些借助简单测试即可识别的 某些形状如生理特性、抗病虫性等。 一个遗传形状必须以两种表型(phenotype) 存在才能用于遗传学分析,每种表型是由相应 基因的不同等位基因(allele)所决定的