五、基因组学 200年玥月5日《 Science》以14页的篇幅刊登和 宣布中国科学家独立绘制完成水稻基因组草图序列 Scienc (总数:46亿),是继人类基因组工作草图之后完 成测定的最大基因组。 材料:籼稻9311”。 完成单位:华大基因研究中心、中科院遗传与 发育生物学研究所等12个单位,2001年7月启动。 水平:水稻基因组的总基因数约为402255615个(接近人类 基因数的两倍),工作框架图序列已覆盖水稻整个基因组92%以上 的基因。 方法:“鸟枪射击法”,利用国产曙光2000、曙光3000超级计算 机(1000亿次秒)对随机DNA碎片进行排序和组装,确定其在基因组 的正确位置。 ,功能其因分和 质研究 6/95
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五、基因组学 202年1月Ne宣布中国独之aure 绘制完成粳稻基因组第四号染色体精确测序图, 我国对国际水稻基因组测序计划贡献率为109。 材料:粳稻“日本睛” 完成单位:中科院国家基因研究中心等4家单位。 水平:第四号染色体中的总碱基数目为035亿碱基对,覆盖了 该染色体全长序列98%的区域,只剩下7个小空洞,碱基序列的精 确度达到999。完整测定的着丝粒序列在高等生物中属于首次。 计划:对预测鉴定的4658个基因作进一步分析,并对着丝粒功 能等作研究
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五、基因组学 国际水稻基因组测序计划 国际水稻(粳稻)基因组计划始于1998年, 日本、美国、中国、法国等国家和地区参加。 染色体4:36Mb(占9-10%。 moring in IREsItIelrsary. 24N1) 8/95
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五、基因组学 2004年3月1日,科学家宣布绘制完成首幅 禽鸟类物种的基因组序列草图。 材料:红原鸡(鸡的远祖)。 完成单位:中国、美国、德国、英国、瑞典、荷兰等。 水平:总碱基数目约为10亿碱基对,该序列草图与人类 基因组序列进行了并列比较(由美国华盛顿大学负责)。同 时完成一张鸡遗传差异图谱(由中科院负责),对红原鸡 肉鸡(英)、蛋鸡(瑞典)、乌鸡(中)进行序列差别分析 作用:鸡是研究低等脊椎动物和人类等哺乳动物的理想 中介,因此在禽流感防治、改善家禽和人类健康等方面有明 显应用价值。 9195
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五、基因组学 一、基因组图谱的构建 基因组中核苷酸顺序的测定方法 利用现有DNA测序方法,每个测序 反应通常只能得到800个核苷酸的序列。 小基因组物种常用鸟枪射击法。 i CANTCCATTA 大基因组测序存在两个问题 DCAECEALCE ⑨片段数()庞大,片段间连接和装配 3 马射击造序列走及配 非常复杂,重叠数为2n2-n 1.待测序的D片段 基因组中相同或相似的重复序列在2.测 的A序列 3两个片阻之到重鲁的序列 连接和装配时容易出错。 解决方法:大规模序列测定前,构建基因组图谱可作为序列测定 中制定测序方案的依据,以便锚定测知的核酸序列在染色体上的位置 10/95
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