蛋白质很少单独的工作,它们倾向于在 个集团内相互合作,即不能由单个蛋白质 去理解其未知的功能,而必须同时研究若干 个蛋白质。所以,了解蛋白质的功能可能由 发现一小段有独特生物化学功能的部分而转 向研究生物过程,或这些生物化学活动参与 途径的辨识以及多个蛋白质各自所起的作用 的辨识。即便如此,恐怕仍不能完全研究其 功能或由于某些蛋白质的缺损而如何导致疾 病的发生。 大
蛋白质很少单独的工作，它们倾向于在 一个集团内相互合作，即不能由单个蛋白质 去理解其未知的功能，而必须同时研究若干 个蛋白质。所以，了解蛋白质的功能可能由 发现一小段有独特生物化学功能的部分而转 向研究生物过程，或这些生物化学活动参与 途径的辨识以及多个蛋白质各自所起的作用 的辨识。即便如此，恐怕仍不能完全研究其 功能或由于某些蛋白质的缺损而如何导致疾 病的发生
●后基因组时代对生物信息学研究的要求产生了 新的变化,这就是: ◇从单因素的影响到多因素影响的研究; ◇从数据的分类、统计到对编码、语法的解读; ◇从偶然、个别的实验结果得到新的知识到对 生物内部活动规律的理解: ◇从单个生物分子到多种生物分子相互作用的 分析。 ●以上,无不要求对生物有内在规律性的理解, 而且都离不开将生物信号与信息作为内涵来理 解
⚫ 后基因组时代对生物信息学研究的要求产生了 新的变化，这就是： 从单因素的影响到多因素影响的研究； 从数据的分类、统计到对编码、语法的解读； 从偶然、个别的实验结果得到新的知识到对 生物内部活动规律的理解； 从单个生物分子到多种生物分子相互作用的 分析。 ⚫ 以上，无不要求对生物有内在规律性的理解， 而且都离不开将生物信号与信息作为内涵来理 解
现有一些研究方法的不足: (1)把基因组序列作为一个整体系统来分析 不够; (2)把物质结构与信息结构联系分析不够; (3)把活性与信息结构联系分析不够 (4)把信息结构作为动力系统的分析不够; (5)作为一种遗传语言的分析不够 ●据此,提出将信息与信息结构作为内涵对基因 组序列作为整体系统分析的设想,以信息系统 的观点了解基因组
⚫ 现有一些研究方法的不足： （1）把基因组序列作为一个整体系统来分析 不够； （2）把物质结构与信息结构联系分析不够； （3）把活性与信息结构联系分析不够； （4）把信息结构作为动力系统的分析不够； （5）作为一种遗传语言的分析不够。 ⚫ 据此，提出将信息与信息结构作为内涵对基因 组序列作为整体系统分析的设想，以信息系统 的观点了解基因组
●生物是在遗传信息与外界信息作用下的一个复 杂、有序的动态系统。 ◇基因组包含生命所需的信息,包括其产物和 调控的信息。 ◇所以,本质上,基因组是一个信息系统 ◇基因组的调控与信息系统的调控具有相同的 规律
⚫ 生物是在遗传信息与外界信息作用下的一个复 杂、有序的动态系统。 基因组包含生命所需的信息，包括其产物和 调控的信息。 所以，本质上，基因组是一个信息系统。 基因组的调控与信息系统的调控具有相同的 规律
生物在各种层次上,是复杂系统 ◇只有从复杂系统特性角度上,才能理解生物 系统的整体性能。 ◇只有从复杂系统的观点,才能准确理解基因 组的结构特点以及基因组、蛋白质组和物种 的进化规律。 ◇复杂系统:大量的单元相互作用而在宏观上 突现出某种整体特性 例如:自相似特性 自组织特性
⚫ 生物在各种层次上，是复杂系统。 只有从复杂系统特性角度上，才能理解生物 系统的整体性能。 只有从复杂系统的观点，才能准确理解基因 组的结构特点以及基因组、蛋白质组和物种 的进化规律。 复杂系统：大量的单元相互作用而在宏观上 突现出某种整体特性。 例如：自相似特性 自组织特性