第二讲 基因组序 列诠释 5. 转录物组 6. 蛋白质组
第二讲 基因组序 列诠释 5. 转录物组 6. 蛋白质组
问题 ❖ 细胞周期的不同时期 ❖ 个体发育不同阶段 ❖ 不同的器官和组织 ❖ 不同的外界环境下 各种基因的表达与否、量的差异、表达 部位如何
问题 ❖ 细胞周期的不同时期 ❖ 个体发育不同阶段 ❖ 不同的器官和组织 ❖ 不同的外界环境下 各种基因的表达与否、量的差异、表达 部位如何
5. 转录物组 5.1 Northern杂交 ❖ 杂交主要步骤： 提取总RNA（不同组织、不同器官） ↓ 变性电泳 ↓ 制备目的基因探针 转移尼龙膜 （放射性 或 化学标记法） 杂 交 ↓ 扫描或放射自显影 ↓ 依据杂交信号的强弱、有无判断基因的表达部位、 表达量、表达时期等
5. 转录物组 5.1 Northern杂交 ❖ 杂交主要步骤： 提取总RNA（不同组织、不同器官） ↓ 变性电泳 ↓ 制备目的基因探针 转移尼龙膜 （放射性 或 化学标记法） 杂 交 ↓ 扫描或放射自显影 ↓ 依据杂交信号的强弱、有无判断基因的表达部位、 表达量、表达时期等
5.2 SAGE SAGE （serials analysis of gene expression） 基因表达系列分析 1995 Velculescu 及其同事年创立
5.2 SAGE SAGE （serials analysis of gene expression） 基因表达系列分析 1995 Velculescu 及其同事年创立
SAGE特点： ❖ 进行转录物组研究，也就是转录水平的研究； ❖ 通过快速和详细分析成千上万个EST来寻找出表达丰度不 同的SAGE标签序列，从而接近完整地获得基因组的表达 信息； ❖ SAGE区别于差异显示、消减杂交等其它技术的主要特点 是可用于寻找那些较低丰度的转录物，最大限度地收集基 因组的基因表达信息，这使之成为从总体上全面研究基因 表达、构建基因表达图谱的首选策略； ❖ SAGE可用于在不同环境、不同生理状态及不同生长阶段 的细胞和组织表达图谱构建，对不同状态下基因表达水平 的定量或定性比较，特别是对疾病组织与正常组织的比较 发展迅速；
SAGE特点： ❖ 进行转录物组研究，也就是转录水平的研究； ❖ 通过快速和详细分析成千上万个EST来寻找出表达丰度不 同的SAGE标签序列，从而接近完整地获得基因组的表达 信息； ❖ SAGE区别于差异显示、消减杂交等其它技术的主要特点 是可用于寻找那些较低丰度的转录物，最大限度地收集基 因组的基因表达信息，这使之成为从总体上全面研究基因 表达、构建基因表达图谱的首选策略； ❖ SAGE可用于在不同环境、不同生理状态及不同生长阶段 的细胞和组织表达图谱构建，对不同状态下基因表达水平 的定量或定性比较，特别是对疾病组织与正常组织的比较 发展迅速；