dbEST是GenBank的一个部分,i 该数据库包括不 同生物的ST序列数据及其他相关信息,主要是从大量 不同组织和器官得到的短mRNA片段。 STS(sequence tagged sites)是序列标记位点 。 dbSTS是NCBI的一个数据源,也是GenBank的一个部 分,包含已知的序列标记位点组成和定位信息。 数理与生物工程学院 2025/5/27 BIOINFORMATICS 36
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 36 dbEST是GenBank的一个部分,该数据库包括不 同生物的EST序列数据及其他相关信息,主要是从大量 不同组织和器官得到的短mRNA片段。 STS(sequence tagged sites)是序列标记位点 。dbSTS是NCBI的一个数据源,也是GenBank的一个部 分,包含已知的序列标记位点组成和定位信息
下面简要介绍NCBI的各项主要服务功能: PubMed是美国国家医学图书馆的一项服务,包括 1950年以来生物医学的大约一千五百万条文献记录。 PubMed同时提供了和文献全文及其它相关资源的链接。 在检索框中输入作者姓名、查询内容关键词或杂志名均 可检索。还有高级检索功能,供特殊检索服务。 理与生物工程学 2025/5/27 BIOINFORMATICS
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 37 下面简要介绍NCBI的各项主要服务功能: PubMed 是美国国家医学图书馆的一项服务,包括 1950年以来生物医学的大约一千五百万条文献记录。 PubMed同时提供了和文献全文及其它相关资源的链接。 在检索框中输入作者姓名、查询内容关键词或杂志名均 可检索。还有高级检索功能,供特殊检索服务
Entrez是NCBI的为用户提供整合的访问序列、定 位、分类和结构数据的搜索和检索系统。Entrez同 时也提供序列和染色体图谱的图形视图。Entrez是 一个查询和搜索系统,该系统集成了NCBI各种数据 库中的信息,包括核酸序列、蛋白质序列、生物大 分子结构、基因组数据、生物分类数据库、孟德尔 人类遗传学数据(OMIM)、电子期刊数据库及生物医 学文献数据库。 数理与生 工程学院 2025/5/27 BIOINFORMATICS 38
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 38 Entrez 是NCBI的为用户提供整合的访问序列、定 位、分类和结构数据的搜索和检索系统。Entrez同 时也提供序列和染色体图谱的图形视图。Entrez是 一个查询和搜索系统,该系统集成了NCBI各种数据 库中的信息,包括核酸序列、蛋白质序列、生物大 分子结构、基因组数据、生物分类数据库、孟德尔 人类遗传学数据(OMIM )、电子期刊数据库及生物医 学文献数据库
Entrez提供多种搜索方式,例如可以将搜索目 标限定在特定的数据库或数据库集合,将搜索范围 约束在特定的数据项,如“种属”、“作者”等。 Entrez可以允许用户按作者、惟一标识符(如登录 号、序列标识)、分子量、序列长度等查询数据库, 用户在查询对话框中输入搜索的条件,各种搜索条 件在默认的情况下是“与”操作,也可以在表述搜 索条件的语句两端加上双引号,将搜索条件当成 “短语”,在数据库中搜索与“短语”匹配的记录。 理与生物 工 程 院 2025/5/27 BIOINFORMATICS 39
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 39 Entrez提供多种搜索方式,例如可以将搜索目 标限定在特定的数据库或数据库集合,将搜索范围 约束在特定的数据项,如“种属” 、 “作者”等。 Entrez可以允许用户按作者、惟一标识符(如登录 号、序列标识)、分子量、序列长度等查询数据库, 用户在查询对话框中输入搜索的条件,各种搜索条 件在默认的情况下是“与”操作,也可以在表述搜 索条件的语句两端加上双引号,将搜索条件当成 “短语” ,在数据库中搜索与“短语”匹配的记录
如果搜索条件不是以短语形式输入,则Entrez将 按“与”的关系在数据库中搜索同时出现各查询“单 词”的记录。使用Entrez非常方便,所有的查询和搜 索操作都可以在Internet浏览器上完成。用户可以利 用Entrez使用界面提供的限制条件(Limits)、索引 (Index)、检索历史(History)和剪贴板(Clipboard) 等功能来实现复杂的检索工作。 数理与生物工程学院 2025/5/27 BIOINFORMATICS 40
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 40 如果搜索条件不是以短语形式输入,则Entrez将 按“与”的关系在数据库中搜索同时出现各查询“单 词”的记录。使用Entrez非常方便,所有的查询和搜 索操作都可以在Internet浏览器上完成。用户可以利 用Entrez使用界面提供的限制条件( Limits)、索引 (Index)、检索历史(History)和剪贴板(Clipboard) 等功能来实现复杂的检索工作