PDB Content Growth 27500 25000 Deposied strctres for the year 250 Total available structures 2x00 1750 150c0 1250 10000 50 2500 0 71万17411万197171e0111g213415117118101m12133134135161o7181200200120m220320m04 Year 图3-2(b)1972-2004蛋白质结构数据库PDB数据增长情况
图3-2(b) 1972-2004蛋白质结构数据库PDB数据增长情况
Size of the Swiss-Prot database 88 .8.080 .88 室 680 () 688688P=2时999358时将888而得3高 学 图3-2(c)1986-2004蛋白质序列数据库SWISS-PROT数据增长情况
图3-2(c) 1986-2004蛋白质序列数据库SWISS-PROT数据增长情况
生物学文献是相关研究的产物,其增长趋势 也是十分惊人的。例如,用“protein”来检索 MEDLINE(通过PubMed的查询界面)中的文献(摘 要),其数量增长如图3-3所示。 数理与生物工程学院 2025/5/27 BIOINFORMATICS 13
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 13 生物学文献是相关研究的产物,其增长趋势 也是十分惊人的。例如,用“protein”来检索 MEDLINE(通过PubMed的查询界面)中的文献(摘 要),其数量增长如图3-3所示
140000 120000 100000 80000 60000 40000 20000 图3-31970-1998用“Protein”检索MEDLINE数据库文献数量的增长情况
图3-3 1970-1998用“Protein”检索MEDLINE数据库文献数量的增长情况
另一方面,文献的内容和热点也在不断变化之 中,特别是在交叉学科领域发展得更快。例如, Andrade和Bork对涉及“genetics”和“disease” 的学术刊物进行了计量分析(图3-4),这些均为 OMIM(online mendelian inheritance in man, http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/)中高 引用率的刊物(引用数每年100篇以上)。 理与生物工程学 2025/5/27 BIOINFORMATICS 15
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 15 另一方面,文献的内容和热点也在不断变化之 中,特别是在交叉学科领域发展得更快。例如, Andrade和Bork对涉及“genetics”和“disease” 的学术刊物进行了计量分析(图3-4),这些均为 OMIM(online mendelian inheritance in man, http : //www. ncbi.n1m.nih.gov/omim/) 中 高 引用率的刊物(引用数每年100篇以上)