分子进化及系统发育分析 分子进化研究目的 ●从物种的一些分子特性出发,构建系统发 育树,进化了解物种之间的生物系统发现 关系 ●通过序列同源性的比较进而了解基因的进 化以及生物系统发生的内在规律 ●系统发育树 ●是表明被认为具有共同祖先的物种演化关 系的树,是一种亲缘分支分类方法
分子进化及系统发育分析 分子进化研究目的 ⚫ 从物种的一些分子特性出发，构建系统发 育树，进化了解物种之间的生物系统发现 关系 ⚫ 通过序列同源性的比较进而了解基因的进 化以及生物系统发生的内在规律 ⚫ 系统发育树 ⚫ 是表明被认为具有共同祖先的物种演化关 系的树，是一种亲缘分支分类方法。 6
系统发育树的构建
系统发育树的构建 7
使用工具 Blast Clustalx MEGA Clusia-1.81 Randy汉化版exe MEGA510 Setup.exe E]SKCA fasta 的序列比对和系统发育树pk
使用工具 ➢ Blast ➢ Clustalx ➢ MEGA 8
Example - Sickle Cell Anemia w]SKCA fasta Human sickle beta-hemoglobin mRNA Gen Bank: M251131 Gen Bank Graphics gi 183944 gb M251131 HUMHEMOB Human sickle beta-hemoglobin mRNA ATGGTGCACCTGACTCCTGTGGAGAAGTCYGCNGTTACTGCNYTNTGGGGCAAGGTGAACGTGGATGAAG TGGTGGTGAGGCCCTGGGCAGGCGCTGGTGGTCACCCTTGGACCCAGAGGITCIGAGTCCTTGG GGATCTGTCCACTCCTGATGCAGTTATGGGCAACCCIAAGGTGAAGGCICATGGCAAGAAAGTGCTCGGT GCCTAGTGATGGCCIGGCTCACCTGGACAACCCAAGGGCACCTTTGCCACACTGAGTGAGCTGCACT GGACAAGCGCACGTGGATCCGAGAACCAGGCTCCGGGCAACGGCGGICIGTGIGCGGCCCA TCACTTTGGCAAAGAATTCACCCCACCAGTGCAGGCAGCCTATCAGAAAGTGGTGGCTGGTGTGGCTAAT GCCcTGGCCCACAAGTATCACTAAGCTCGCTTTCTTGCTGTCCAATTTCTATTAAAGGTTCCTTTGTTCC CAAGTCCAACACAAACGGGGGATATATGAAGGGCCTGAGCATCIGGATTCGCCAATAAAAAA CATTTATTTTCATTGC
➢ Example-Sickle Cell Anemia 9
实验流程 段序列 品三 同源序列 >多序列比对 >系统发育树
实验流程 一段序列 同源序列 多序列比对 系统发育树 Blast MEGA 10