第十章微生物的分类和鉴定 微生物分类学( microbial taxonomy) 微生物系统学( microbial systematics 分类学的三个任务:分类、鉴定、命名 目的:熟知物种多样性;开发和利用物种资源。 ●第一节通用分类单元 ●第二节微生物在生物界的地位 ●第三节各大类微生物的分类系统纲要 ●第四节微生物的鉴定
第十章 微生物的分类和鉴定 微生物分类学(microbial taxonomy) 微生物系统学(microbial systematics) 分类学的三个任务：分类、鉴定、命名 目的：熟知物种多样性；开发和利用物种资源。 ⚫ 第一节 通用分类单元 ⚫ 第二节 微生物在生物界的地位 ⚫ 第三节 各大类微生物的分类系统纲要 ⚫ 第四节 微生物的鉴定
第一节通用分类单元 种以上的系统分类单元 (一)七级分类单元 界 Kingdom(拉: Regnun) 门 Phylum(拉: phylum)或(拉: Divisio) 纲Cass(拉: Classis 目 Order(拉:Ozo) 科Fami!y(拉: familia) 属 Genus(拉:Gens) 种 Species(拉: species)
第一节 通用分类单元 一、种以上的系统分类单元 （一）七级分类单元 界 Kingdom （拉：Regnum） 门Phylum（拉：phylum）或（拉：Divisio） 纲Class（拉：Classis） 目Order（拉：Ordo） 科Family（拉：Familia） 属Genus（拉：Genus） 种Species（拉：Species）
(二)种的概念: 种是一个基本分类单位,它是一大群表型特征高度相 似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差 异的菌株的总称。 ●在微生物中,—个种只能用该种内的一个典型菌株 type strain)来作具体标本,故这一典型菌株就是该种 的模式种( (type species ●种的定义应建立在遗传物质即DNA鉴定的基础上,把 DNA同源性的大小作为划分种的标准 ●新种( species nova,pnov或 nov sp.):是权威性的 分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过 的微生物
（二）种的概念： ⚫ 种是一个基本分类单位，它是一大群表型特征高度相 似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差 异的菌株的总称。 ⚫ 在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株 (type strain)来作具体标本，故这一典型菌株就是该种 的模式种(type species)。 ⚫ 种的定义应建立在遗传物质即DNA鉴定的基础上，把 DNA同源性的大小作为划分种的标准。 ⚫ 新种（species nova, sp.nov或nov sp.）:是权威性的 分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过 的微生物
三)种的分类地位举例 三种微生物的分类地位举例 分类单元 海扇脊螺旋体 灰色链霉菌 八孢裂殖酵母 界门 原核生物界 原核生物界 真菌界 薄壁菌门 厚壁菌门 真菌门 亚门 子囊菌亚门 暗细菌纲 枝形细菌纲 半子囊菌纲 纲目科属种 螺旋体目 放线菌目 内孢霉目 螺旋体科 链霉菌科 内孢霉科 脊螺旋体属 链霉菌属 裂殖酵母属 海扇脊螺旋体 灰色链霉菌 八孢裂殖酵母 分类系统伯杰氏手册(1984)伯杰氏手册(1984) Ainsworth(1971)
（三）种的分类地位举例 ⚫ 三种微生物的分类地位举例： 分类单元 海扇脊螺旋体 灰色链霉菌 八孢裂殖酵母 界 原核生物界 原核生物界 真菌界 门 薄壁菌门 厚壁菌门 真菌门 亚门 ―― ―― 子囊菌亚门 纲 暗细菌纲 枝形细菌纲 半子囊菌纲 目 螺旋体目 放线菌目 内孢霉目 科 螺旋体科 链霉菌科 内孢霉科 属 脊螺旋体属 链霉菌属 裂殖酵母属 种 海扇脊螺旋体 灰色链霉菌 八孢裂殖酵母 分类系统 伯杰氏手册（1984） 伯杰氏手册（1984） Aingsworth(1971)
学名 学名=属名+种名加词+(首次定名人)+现名定名人+定 名年份 (必要,用斜体排字) (可省略,均用正体排字) 举例: 金黄葡莓菌 Staphylococcus aureus rosenback 猪霍乱沙门氏菌 Salmonella cholerae-suis(Smith) Weldin, 1927 Bacillus cholerae-suis Smith, 1894 蜡状芽孢杄菌荧光变种 bACillus cereus var, fluorescens Laubach variety
二、学名 学名＝ 属名＋种名加词 ＋（首次定名人）＋现名定名人＋定 名年份 （ 必要，用斜体排字） （可省略，均用正体排字） 举例： 金黄葡萄菌 ： Staphylococcus aureus Rosenback 猪霍乱沙门氏菌 ： Salmonella cholerae-suis (Smith) Weldin,1927 Bacillus cholerae-suis Smith,1894 蜡状芽孢杆菌荧光变种： 把Bacillus cereus var. fluorescens Laubach variety