NCBI NR&NT比对结果 onr&nt注释结果 Query: Kale Unigene BMK. 37801 te"⊥ coVers Database: All non-redundant Gen Bank CDs translations+PDB+SwissProt+PIR+PRE excluding environmental samplea from wGs pro]ects 13,, 630 sequences; 4, 577,707, 277 total letters Searching done sc。re Sequences producing significant alignments: (上its)Va1t reflXP 002891687.11 hypothetical protein ARALYDRAFT 474348 [Arab 3602e-97 refINP 001117469.11 unknown protein [Arabidopsis thaliana] >gil1.. 348 6e-94 dbj BAFo0450 1l putative bzIp protein [Arabidopsis thaliana] 3486e-94 gblAAk96499.11 At1g52320/F19k6 7 [Arabidopsis thaliana] >gil2330 3486e-94 refINP 849796.21 unknown protein [Arabidopsis thaliana] >gi|1232 3486e-94 reflXP 002304191.11 predicted protein [Populus trichocarpa] >gil 2449e-63 reflXP 002299694 1l predicted protein [Populus trichocarpa] >gil... 237 le-60
NR&NT比对结果 nr&nt注释结果
UniProt UNIPROT o Uniprot(Universal Protein Resource) UniProt是一个集中收录蛋白质资源并能与其它资源相互 联系的数据库,也是目前为止收录蛋白质序列目录最广 泛、功能注释最全面的一个数据库。 整合三大数据库: Swissprot、 TrEMBL、PIR( Protein Information Resource 数据库组成: UniprotKB(知识库)、 Uniprotarc(归档) 、 Uniref(参考资料库)
UNIPROT Uniprot(Universal Protein Resource) UniProt是一个集中收录蛋白质资源并能与其它资源相互 联系的数据库,也是目前为止收录蛋白质序列目录最广 泛、功能注释最全面的一个数据库。 整合三大数据库:Swissprot、TrEMBL、PIR(Protein Information Resource)。 数据库组成:UniprotKB(知识库)、Uniprotarc(归档) 、Uniref(参考资料库)
UniProt UNIPROT简介 o Uniprot数据库的最重要组成部分 UniprotkB(Uniprot knowledgebase UniProtKB Protein knowledgebase, consists of two sections Swiss-Prot, which is manually annotated and reviewed TrEMBL, which is automatically annotated and is not reviewed includes complete and reference proteome sets. UniRef Sequence clusters, used to speed up sequence similarity searches UniParc Sequence archive, used to keep track of sequences and their identifiers
UNIPROT简介 UniProtKB Protein knowledgebase, consists of two sections: Swiss-Prot, which is manually annotated and reviewed. TrEMBL, which is automatically annotated and is not reviewed. Includes complete and reference proteome sets. UniRef Sequence clusters, used to speed up sequence similarity searches. UniParc Sequence archive, used to keep track of sequences and their identifiers. Uniprot数据库的最重要组成部分 UniprotKB(Uniprot knowledgebase)
UniProt S UniProtKB/Swiss-Prot o UniProtKB/ Swiss-Prot 主要收录人工注释的序列及其相关文献信息和经过计算 机辅助分析的序列。这些注释都是由专业的生物学家给 出的,准确性无需置疑 注释结果全面翔实,注释包括对蛋白质功能、酶学特性 、剪接异构体、相关疾病信息的注释等等。 注释结果无冗余。 http://web.expasy.org/docs/relnotes/relstat.html
UniProtKB/Swiss-Prot UniProtKB/Swiss-Prot 主要收录人工注释的序列及其相关文献信息和经过计算 机辅助分析的序列。这些注释都是由专业的生物学家给 出的,准确性无需置疑。 注释结果全面翔实,注释包括对蛋白质功能、酶学特性 、剪接异构体、相关疾病信息的注释等等。 注释结果无冗余。 http://web.expasy.org/docs/relnotes/relstat.html
IniProt: UNIPROTKB/TREMBL UniprotKB/ TrEMBL 主要收录的则是高质量的经计算机分析后进行自动注释 和分类的序列。 由于大规模测序产生的海量数据无法通过 Swissprot的严谨 注释思路来进行注释。 TrEMBL存储了比较全面完整的物 种编码序列信息。 存在冗余。 http://www.ebi.ac.uk/uniprot/tremblstats/
UNIPROTKB/TREMBL • UniprotKB/TrEMBL 主要收录的则是高质量的经计算机分析后进行自动注释 和分类的序列。 由于大规模测序产生的海量数据无法通过Swissprot的严谨 注释思路来进行注释。TrEMBL存储了比较全面完整的物 种编码序列信息。 存在冗余。 http://www.ebi.ac.uk/uniprot/TrEMBLstats/