UniProt UNIPROT注释途径 o网页提交序列 本地 Blast ohttp://www.uniprot.org Uniprot a Search Blast Align Retrieve ID Mapping Sequence or UniProt identifier Blast 执行比对 争序列信息 Clear Options BLAST比对e值 Database Threshold Matrix Filtering Gapped Hits UniProtKB Auto nOne yesv250
UNIPROT注释途径 网页提交序列 本地BLAST http://www.uniprot.org/
COG Clusters of Orthologous Groups of proteins(COGs) 蛋白质直系同源数据库。 通过对茵类,藻类和真核生物等66个完整基因组的编码 蛋白,根据系统进化关系构建而成。 对于预测单个蛋白的功能和整个基因组中蛋白质的功能 具有重要的作用。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/cog
COG • Clusters of Orthologous Groups of proteins (COGs) 蛋白质直系同源数据库。 通过对菌类，藻类和真核生物等66个完整基因组的编码 蛋白，根据系统进化关系构建而成。 对于预测单个蛋白的功能和整个基因组中蛋白质的功能 具有重要的作用。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/
COG COGS Phylogenetic classification of proteins encoded in complete genomes Chesters of Orthologous Groups of proteins(COGs)were delineated by comparing protein sequences encoded in complete genomes, representing major phylogenetic paralogs from at eages and thus corresponds to an ancient conserved domain. 66 get Unicellular clusters FTP Eukaryotic clusters FTP 8 orders Code Abbreviation 28 classes Science19970ct2427853389631-7 B. C Bioinformatics 2003 Sep 11:4(): 41 Euryarchaeota actinobacteria c Caenorhabditis elegans cel Mth Aquificales Cel Mtu MtC Mle alobacteniales Hbs Thermoplasmatales Tac Iro ThemotogalesImaClostridiales Cac Sau lin Bsu bha Cyanobacteria H Homo sapiens lsa Archaeozlobale Lactobacillales Lla Spy Spn (human) Methanopvrales Ma Mycoplasmatales Cur Mpu Mpn Mge Chroococcales Syn Saccharomyces cerevisiae Methanosarcinales Mac aker yeast) Deinococcus. herms Crenarchaeota P izosaccharomyces pombe Thermoproteales Enterobacteriales Eco EcZ Ecs Ype Sty (fission yeast) Fusobacteria Vibnionales Desulfurococcales Ape Fusobacterales Enu Vch microsporidia)
COG
KEGG注释途径 o网络提交任务 go blast gohttp:/www.genome.jp/tools/blast/ BLAST FASTA KEGG2 Compute ) Clear Enter query sequence: (in one of the three forms quence I (Example) mja: MJ 1041 Local file name 浏览. Sequence data Select program and database o BLASTP Aprot query vs prot db)O KEGG GENES o BLASTX (nucl query vs prot db) o Favorite organism code or category O KEGG MGENES KEGG VGENES
KEGG注释途径 网络提交任务 blast http://www.genome.jp/tools/blast/
KEGG注释结果 O BLAST比对结果 Query= Kale Unigene BMK. 1 (2226 letters) Database 9.0e0 181,552 sequences: 2, 219,841,672 total letters Searching.. done sc。re Sequences producing significant alignments bits) Value hmo: HM1 3149 hypothetical protein 2029e-50 lcr: ICRIs 00452 pg1 protein, homology to Homo sapiens 1636e-38 ◎根据比对结果提取代谢通路图 根据基因对应的KO号 可以从KEGG官网得到对应的 PATHWAY图片
KEGG注释结果 BLAST比对结果 根据比对结果提取代谢通路图 根据基因对应的KO号 可以从KEGG官网得到对应的PATHWAY图片