影响Tm的因素有哪些?
影响Tm 的因素有哪些?
√在A,T,C,G随机分布的情况下,决定于GC含量 GC%愈高 Tm值愈大 GC%愈低 → Tm值愈小 √GC%含量相同的情况下 AT形成变性核心,变性加快,Tm值小
✓ 在A,T,C,G随机分布的情况下,决定于GC含量 GC%愈高 Tm值愈大 GC%愈低 Tm值愈小 ✓ GC%含量相同的情况下 AT形成变性核心,变性加快,Tm值小
碱基对排列对Tm值具有明显影响 5'GC3 5 CGn > Tm 3 5 3 ※嘌呤嘧啶的排列顺序对双螺旋结构(稳定性)的影响 一氢键数目相同,但相邻碱基的堆积力不同 从嘌呤到嘧啶方向的碱基堆积力作用显著地大于同样组 成的嘧啶到嘌呤方向的碱基堆积作用
碱基对排列对Tm值具有明显影响 GC CG CG GC TA AT AT TA 5’ 3’ 3’ 3’ 5’ 5’ 5’ 3’ >> >> Tm ※嘌呤嘧啶的排列顺序对双螺旋结构(稳定性)的影响 -氢键数目相同,但相邻碱基的堆积力不同 从嘌呤到嘧啶方向的碱基堆积力作用显著地大于同样组 成的嘧啶到嘌呤方向的碱基堆积作用 n n n n