根据基因芯片的应用又主要分为两大 类:用于研究基因型和用于检测RNA的表 达。从本质上来讲,前者实际上是利用基 因芯片进行序列分析,其中包括识别DNA 序列的突变和研究DNA的多态性;而后者 则是利用基因芯片研究序列的功能。 数理与生物工程学 2025/5/27 BIOINFORMATICS 26
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 26 根据基因芯片的应用又主要分为两大 类:用于研究基因型和用于检测RNA的表 达。从本质上来讲,前者实际上是利用基 因芯片进行序列分析,其中包括识别DNA 序列的突变和研究DNA的多态性;而后者 则是利用基因芯片研究序列的功能
7.3.1.2基因芯片的基本流程 病人 对照 DNA或cDNA克隆 PCR扩增 mRNA 探针DNA 逆转录荧光标记 旺 >。 印记 DNA 玻片 杂交 ↓图像处理 数据分析 图8-1cDNA微阵列工作流程图
7.3.1.2 基因芯片的基本流程 图8-1 cDNA微阵列工作流程图
基因芯片技术包括四个主要步骤:芯 片制备、样品制备、杂交反应、信号检测 和结果分析。首先提出基因芯片所要解决 的问题,确定研究目标,例如,研究基因 的SNP。检测或分析DNA的变异或者进行 基因差异表达的研究。 数理与生物工程学 2025/5/27 BIOINFORMATICS 28
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 28 基因芯片技术包括四个主要步骤:芯 片制备、样品制备、杂交反应、信号检测 和结果分析。首先提出基因芯片所要解决 的问题,确定研究目标,例如,研究基因 的SNP。检测或分析DNA的变异或者进行 基因差异表达的研究
根据所要解决的问题,选择一组特定的 基因对象。其次,根据所选择的基因序列, 设计探针序列以及探针在芯片上的分布。然 后根据设计结果制备基因芯片,制备方法大 致分为在片合成法和点样法。接下来就是对 靶基因即待测样品进行扩增和标记,然后进 行杂交实验,并对基因芯片的杂交结果进行 检测,最后根据获得的荧光图谱,进行数据 数理与生 处理分析,报告检测结果,并将相应的数据 存入数据库。 工程学院 2025/5/27 BIOINFORMATICS 29
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 29 根据所要解决的问题,选择一组特定的 基因对象。其次,根据所选择的基因序列, 设计探针序列以及探针在芯片上的分布。然 后根据设计结果制备基因芯片,制备方法大 致分为在片合成法和点样法。接下来就是对 靶基因即待测样品进行扩增和标记,然后进 行杂交实验,并对基因芯片的杂交结果进行 检测,最后根据获得的荧光图谱,进行数据 处理分析,报告检测结果,并将相应的数据 存入数据库
1、基因芯片的制备 基因芯片的制备主要包括两个方面: 一是基因芯片的设计;二是基因芯片的制 作。前者又包括基因芯片上探针的设计和 探针在芯片上布局的设计。 数理与生物工程学院 2025/5/27 BIOINFORMATICS 30
2025/5/27 BIOINFORMATICS 数 理 与 生 物 工 程 学 院 30 1、基因芯片的制备 基因芯片的制备主要包括两个方面: 一是基因芯片的设计;二是基因芯片的制 作。前者又包括基因芯片上探针的设计和 探针在芯片上布局的设计