整个启动子应包括-10和-35两个区域。 35序列 Pribnow box TB A65 Cs A45 16-19 bases mAsA4|5-9b8转录起点 说明: 这两个区域的顺序来自于E.coi,它并不代表所有原 核生物 定点突变的结果表明,启动子的作用是整个区域 而不是单个核苷酸,但单个核苷酸的突变会导致转 录水平的上升或下降,特别是A①突变为GC下降 更明显
整个启动子应包括-10和-35两个区域。 说明: •这两个区域的顺序来自于E.coli,它并不代表所有原 核生物。 •定点突变的结果表明,启动子的作用是整个区域 而不是单个核苷酸,但单个核苷酸的突变会导致转 录水平的上升或下降,特别是A/T突变为G/C下降 更明显
启动子的功能:是RNA聚合酶结合的位点,决定 转录的起始位点及链的选择。-10区是核心酶结合 的位点,-35区是o因子结合的位点。 (1) R R s 2) (3)
•启动子的功能:是RNA聚合酶结合的位点,决定 转录的起始位点及链的选择。-10区是核心酶结合 的位点,-35区是σ因子结合的位点
CRP结合位点( CAMP reception protein binding site 原核生物的基因上游除了含有启动子外,在某些 编码分解代谢的揉纵子前面还有一些与某种调节因 子相结合的位点,从而对基因的表达起调控作用。 其中研究得较多的是E.coli乳糖操纵子与cAMP受体 蛋白的结合位点,这个位点也称为CAP位点 ( catabolite gene activation protein site) ),位于-50 -70之间,含有两小段回文对称结构: CAATTAATGTGAGTTAGCTCA CTCATTA
•CRP结合位点(cAMP reception protein binding site) 原核生物的基因上游除了含有启动子外,在某些 编码分解代谢的操纵子前面还有一些与某种调节因 子相结合的位点,从而对基因的表达起调控作用。 其中研究得较多的是E.coli乳糖操纵子与cAMP受体 蛋 白的 结合 位点 ,这 个位点 也称 为 CAP 位 点 (catabolite gene activation protein site) ,位于-50~ -70之间,含有两小段回文对称结构: CAATTAATGTGAGTTAGCTCA CTCATTA
起录点、SD顺序及起译点 起录点:所谓的起录点是指转录的起始点。这 位点位于启动子-10区的下游10bp处,原核生物基 因起录点附近的三个核苷酸,大多数基因是CAT, 所以在原核生物中也常用CAT表示起录点。但并不 是绝对的,有时会有变化,如CAC,TAC等。一般 来说,起录点可用 PyA/gPus表示(Ag表示大多数 凊况下是A,少数情况下是G)。转录就是从A/g 位点开始
二、起录点、SD顺序及起译点 •起录点:所谓的起录点是指转录的起始点。这一 位点位于启动子-10区的下游10bp处,原核生物基 因起录点附近的三个核苷酸,大多数基因是CAT, 所以在原核生物中也常用CAT表示起录点。但并不 是绝对的,有时会有变化,如CAC,TAC等。一般 来说,起录点可用PyA/gPu表示(A/g表示大多数 情况下是A,少数情况下是G)。转录就是从A/g 位点开始
翻译识别点(SD顺序):这一位点是核糖体识别并与 mRNA结合的位点。在每个基因起始点的下游都有一小段 富含嘌呤的顺序与5′ AGGAGG3′。这一顺序可与核糖体 30S亚基上的16 S rrNA的3’末端富含嘧啶的顺序 5’ CCUCCU3’互补,这一顺序就称为 Shine- Dalgarno (SD顺序)。 典型的SD顺序是 AGGaGG,但事实上在这6bp中,只 要有连续的3个以上bp与 CCUCCU互补,便可作为核糖体 的识别顺序,但是SD的长度会直接影响mRNA与核糖 体结合的紧密度,从而影响翻译效率 SD顺序位于起录点下游,起译点上游,距起译点5 16bp,而与CAT的距离变化较大。 起译点:所谓的起译点就是翻译的起始位点。在原核生 物中一般是ATG,极少数是GTG,编码fMet
•翻译识别点(SD顺序):这一位点是核糖体识别并与 mRNA结合的位点。在每个基因起始点的下游都有一小段 富含嘌呤的顺序与5’AGGAGG3’ 。这一顺序可与核糖体 30S亚基上的16S rRNA的3’末端富含嘧啶的顺序 5’CCUCCU3’互补,这一顺序就称为Shine-Dalgarno (SD顺序)。 典型的SD顺序是AGGAGG,但事实上在这6bp中,只 要有连续的3个以上bp与CCUCCU互补,便可作为核糖体 的识别顺序,但是SD的长度会直接影响mRNA与核糖 体结合的紧密度,从而影响翻译效率。 SD顺序位于起录点下游,起译点上游,距起译点5 -16bp,而与CAT的距离变化较大。 •起译点:所谓的起译点就是翻译的起始位点。在原核生 物中一般是ATG,极少数是GTG,编码fMet