四、酶高效催化的策略 1、邻近与定向效应 2、诱导契合与底物扭曲变形 3、共价催化 4、酸硷催化 5、微环境影响 实例: lysozyme chymotrypsin carboxypeptidase RNase
四、酶高效催化的策略 1、 邻近与定向效应 2、 诱导契合与底物扭曲变形 3、 共价催化 4、 酸硷催化 5、微环境影响 实例: lysozyme chymotrypsin carboxypeptidase RNase
酶分子中可作为亲核基团和酸硷催化的功能基团 亲核基团亲电子原子 氨基酸种类酸催化基团(质子供体)碱催化基团(质子受体) 丝氨酸羟基-CH2-0 Glu. Asp COOH COO H LyS NHi NH, C SH 半胱氨酸巯基-CH2-S Tyr OH C=CH C=CH 一CH2-C=CH lis HN NH HN 组氨酸咪唑基 C H
酶分子中可作为亲核基团和酸硷催化的功能基团
G 羧肽酶结合底物前后构象变化 Ars A g 8 底 物
Zn Zn Glu270 Tyr248 Arg145 底物 羧肽酶结合底物前后构象变化
R A.非差 示标记 (底物 差示标记法图解 B 差 示 R 标记 R R
差示标记法图解 RR R R R* A.非差 示标记 B. 差示 标记 R R R* (底物 ) R
溶菌酶催化的反应 NAG:N-乙酰氨基葡萄糖 NAM:N-乙酰氨基葡萄糖乳酸 NAG NAM NAG CH-OH CH-OH CH, OH CHOH OH 0 OR OH OR N一H N一H N-H 0=C 0=C CH CH H,o CH,OH CH,OH CHOH CH, OH OH OH OR H OR HO N一H CH CH NAG NAG NAM Figure 9-4
溶菌酶催化的反应 NAG:N-乙酰氨基葡萄糖 NAM:N-乙酰氨基葡萄糖乳酸