3节:工业微生物 3节:工业微生物简介 1、酿酒工业 白酒:四大名酒,五大香型 啤酒、黄酒、葡萄酒(威士忌、白兰地、伏特加、朗姆、金酒 2、酒精工业 3、溶剂工业(丙酮、丁醇) 4、有机酸工业:乳酸、柠檬酸、衣康酸、延胡索酸、琥珀酸、苹果酸、酒石酸等。 5、抗生素工业 6、酶制剂工业 7、氨基酸工业 8、酵母工业 9、多糖工业:黄原胶、右旋糖苷、等等 10、石油发酵 l1、生物活性物质:核酸类、维生素等 12、其它:微生物农药、沼气发酵、生物制品(菌苗、疫苗) 4节:微生物分类 Microbial taxonomy 分类主要是探索生物之间的亲缘关系,把它们归纳为互相联系的不同类群。 具体任务就是分类、鉴定和命名 、分类单位与命名 (一)分类单位 界,门,纲,目,科属种 种是最基本的分类单位它是一大群表型特征高度相似,亲缘关系极其相近,与同属内其 它种有着明显差异的菌株的总称。 种以下又分亚种(变种)型,类群,菌株(品系) 菌株(品系) strain;表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖成的纯种群体及其一切后代。 (二)命名 命名按照《国际细菌命名法规》,采用林奈氏双名法 属名+种名+命名人
3 节:工业微生物... 3 节:工业微生物简介 1、酿酒工业 白酒:四大名酒,五大香型 啤酒、黄酒、葡萄酒(威士忌、白兰地、伏特加、朗姆、金酒) 2、酒精工业 3、溶剂工业(丙酮、丁醇) 4、有机酸工业: 乳酸、柠檬酸、衣康酸、延胡索酸、琥珀酸、苹果酸、酒石酸等。 5、抗生素工业 6、酶制剂工业 7、氨基酸工业 8、酵母工业 9、多糖工业:黄原胶、右旋糖苷、等等 10、石油发酵 11、生物活性物质:核酸类、维生素等 12、其它:微生物农药、沼气发酵、生物制品(菌苗、疫苗) 4 节:微生物分类 Microbial taxonomy 分类主要是探索生物之间的亲缘关系,把它们归纳为互相联系的不同类群。 具体任务就是分类、鉴定和命名。 一、分类单位与命名 (一)分类单位: 界,门,纲,目,科,属,种 种是最基本的分类单位,它是一大群表型特征高度相似,亲缘关系极其相近,与同属内其 它种有着明显差异的菌株的总称。 种以下又分亚种(变种),型,类群,菌株(品系) 菌株(品系)(strain): 表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖成的纯种群体及其一切后代。 (二)命名 命名按照《国际细菌命名法规》,采用林奈氏双名法。 属名 + 种名 +命名人
如大肠杆菌: Escherichia coli( Migula) Castellani& Chalmers919 属名:名词,大写首字母,一般描绘主要形态或生理特征 种名形容词,小写,代表一个种次要特征。 未确定种名或不指特定的种时,可在属名后加sp.表示。 举例 真菌界 Fungi 真菌门 Eumycophyta 子囊菌纲 Ascomycetes 原子囊亚纲 Protoascomycetes 内孢霉目 Endomycetales 内孢霉科 Endomycetaceae 酵母亚科 Sacchromycetoideae 酵母属 Sacchromyces 酿酒酵母S. cerevisiae hansen 、分类依据 1、形态特征(个体和群体) 细胞形态:形状、大小、排列、染色反应等 培养:固体—菌落,半固体一穿刺,液体。 2、生理生化反应 营养要求:碳源、氮源、营养类型 代谢产物:种类、产量、显色反应 酶:产酶种类、反应特性 3、生态学特征 相互关系、宿主种类、与氧关系等 4、生活史 5、血清学反应 近年又发展了红外光谱,GC含量,DNA杂交等 三、分类方法 (一)经典分类法
如大肠杆菌: Escherichia coli (Migula) Castellani & Chalmers 1919 属名:名词,大写首字母,一般描绘主要形态或生理特征。 种名:形容词,小写,代表一个种次要特征。 未确定种名或不指特定的种时,可在属名后加 sp.表示。 举例 真菌界 Fungi 真菌门 Eumycophyta 子囊菌纲 Ascomycetes 原子囊亚纲 Protoascomycetes 内孢霉目 Endomycetales 内孢霉科 Endomycetaceae 酵母亚科 Sacchromycetoideae 酵母属 Sacchromyces 酿酒酵母 S. cerevisiae Hansen 二、分类依据 1、形态特征(个体和群体) 细胞形态:形状、大小、排列、染色反应等。 培养:固体— 菌落,半固体— 穿刺,液体。 2、生理生化反应 营养要求:碳源、氮源、营养类型 代谢产物:种类、产量、显色反应 酶:产酶种类、反应特性 3、生态学特征 相互关系、宿主种类、与氧关系等。 4、生活史 5、血清学反应 近年又发展了红外光谱,GC 含量,DNA 杂交等。 三、分类方法 (一)经典分类法
随机地和不系统地根据一些特征进行分类。主要是形态、生理生化特征。 (二)数值分类法 根据较多特征分类,每一特征地位相同。 1、每一菌株为一操作单位,确定很多特征(50-60个) 2、比较菌株间的最大相似性 阳性和阴性符合的总和 ×100% 总的测定数-无效测定数 >85%为同种,>65%为同属 3、据数值绘出矩阵图并转换成树状谱。 (三)分子与遗传方法 1、DNA碱基组成:GC% 相同不能说明是同种,但不同则肯定不是同种。 差别>10%不是同种,<10%可能是同种。 2、核酸分子杂交 比较碱基顺序的同源性 3、16 SIRNA寡核苷酸编目分析 水解rRNA产生一系列寡核苷酸片段,顺序分析。 近年来,采用红外、核磁、电镜等新技术越来越广泛 四、分类系统 原核生物 《伯杰氏细菌鉴定手册》第8版,1973 《伯杰氏系统细菌学手册》第9版,1984 真菌: Ainsworth(1973)系统 酵母: Lodder分类系统 菌种鉴定工作三部曲 获得该微生物的纯培养 2、测定一系列必要的鉴定指标 3、查找权威性鉴定手册
随机地和不系统地根据一些特征进行分类。主要是形态、生理生化特征。 (二)数值分类法 根据较多特征分类,每一特征地位相同。 1、每一菌株为一操作单位,确定很多特征(50—60 个) 2、比较菌株间的最大相似性 阳性和阴性符合的总和 ---------------------------------× 100% 总的测定数 --- 无效测定数 >85%为同种,>65%为同属 3、据数值绘出矩阵图并转换成树状谱。 (三)分子与遗传方法 1、DNA 碱基组成:GC% 相同不能说明是同种,但不同则肯定不是同种。 差别>10%不是同种,<10%可能是同种。 2、核酸分子杂交 比较碱基顺序的同源性 3、16s rRNA 寡核苷酸编目分析 水解 rRNA 产生一系列寡核苷酸片段,顺序分析。 近年来,采用红外、核磁、电镜等新技术越来越广泛。 四、分类系统 原核生物: 《伯杰氏细菌鉴定手册》第 8 版,1973 《伯杰氏系统细菌学手册》第 9 版,1984 真菌:Ainsworth (1973)系统 酵母:Lodder 分类系统 菌种鉴定工作三部曲 1、获得该微生物的纯培养 2、测定一系列必要的鉴定指标 3、查找权威性鉴定手册
章:微生物类群与形态结构 非细胞型:病毒 细胞型:原核微生物:细菌、放线菌等, 无明显核,也无核膜、核仁。 真核微生物:酵母菌、霉菌, 有明显核,有核膜、核仁。 1节:细菌 Bacteria 是微生物一大类群,主要研究对象。 细菌是单细胞的,大小在lum左右,1000倍以上显微镜才能看到其形状。 、细菌的形态和大小 (一)基本形态 1、球菌 Coccus:球形或近球形,根据空间排列方式不同又分为单、双、链、四联、八 叠、葡萄球菌。不同的排列方式是由于细胞分裂方向及分裂后情况不同造成的。 2、杆菌 Bacillus( Bacterium):杆状或圆柱形,径长比不同,短粗或细长。是细菌中种类 最多的。 3、螺旋菌 Spirillum:是细胞呈弯曲杆状细菌统称,一般分散存在。根据其长度、螺旋 数目和螺距等差别,分为弧菌 Vibrio(菌体只有一个弯曲,形似C字)和螺旋菌(螺旋 状,超过1圈)。 与螺旋体 Spirochaeta区别:无鞭毛。 细菌形态不是一成不变的,受环境条件影响(如温度、培养基浓度及组成、菌龄等) 异常形态 般,幼龄,生长条件适宜,形状正常、整齐。老龄,不正常,异常形态。 畸形:由于理化因素刺激,阻碍细胞发育引起。 衰颓形:由于培养时间长,细胞衰老,营养缺乏,或排泄物积累过多引起。 (二)细菌大小 如何测量:显微测微尺 球菌直径05-1um 杆菌直径05-1um,长为直径1-几倍 螺旋菌直径03-1um,长1-50um
一章:微生物类群与形态结构 非细胞型:病毒 细胞型:原核微生物:细菌、放线菌等, 无明显核,也无核膜、核仁。 真核微生物:酵母菌、霉菌, 有明显核,有核膜、核仁。 1 节:细菌 Bacteria 是微生物一大类群,主要研究对象。 细菌是单细胞的,大小在 1um 左右,1000 倍以上显微镜才能看到其形状。 一、细菌的形态和大小 (一)基本形态 1、球菌 Coccus:球形或近球形,根据空间排列方式不同又分为单、双、链、四联、八 叠、葡萄球菌。不同的排列方式是由于细胞分裂方向及分裂后情况不同造成的。 2、杆菌 Bacillus (Bacterium):杆状或圆柱形,径长比不同,短粗或细长。是细菌中种类 最多的。 3、螺旋菌 Spirillum:是细胞呈弯曲杆状细菌统称,一般分散存在。根据其长度、螺旋 数目和螺距等差别,分为弧菌 Vibrio(菌体只有一个弯曲,形似 C 字)和螺旋菌(螺旋 状,超过 1 圈)。 与螺旋体 Spirochaeta 区别:无鞭毛。 细菌形态不是一成不变的,受环境条件影响(如温度、培养基浓度及组成、菌龄等) 异常形态 一般,幼龄,生长条件适宜,形状正常、整齐。老龄,不正常,异常形态。 畸形:由于理化因素刺激,阻碍细胞发育引起。 衰颓形:由于培养时间长,细胞衰老,营养缺乏,或排泄物积累过多引起。 (二)细菌大小 如何测量:显微测微尺 球菌直径 0.5-1um 杆菌直径 0.5-1um ,长为直径 1-几倍 螺旋菌直径 03-1um,长 1-50um
细菌大小也不是一成不变的。 细胞重量10-13-10-12g,每g细菌含1-10万亿个细菌。 二、细菌细胞结构 研究细菌细胞结构是分子生物学重要内容之一,有了电子显微镜才有可能 其结构分为基本结构和特殊结构 基本结构是细胞不变部分,每个细胞都有,如细胞壁、膜、核。 特殊结构是细胞可变部分,不是每个都有,如鞭毛、荚膜、芽孢。 (一)基本结构 l、细胞壁 cell wall:位于细胞表面,较坚硬,略具弹性结构。 功能:1)维持细胞外形;2)保护细胞免受机械损伤和渗透压危害;3)鞭毛运动支点 4)正常细胞分裂必需;5)一定的屏障作用;6)噬菌体受体位点所在。另外与细菌的抗 原性、致病性有关 革兰氏染色 Cristein gram,1884发明(Koch实验室) 染色过程:(插入 凡是不能被乙醇脱色,呈蓝紫色,称为革兰氏阳性菌G+ 凡是经乙醇脱色,呈复染剂颜色,称为革兰氏阴性菌G- 结果不同主要是细胞壁组成及结构差异造成的 (1)革兰氏阳性菌 Gram positive 以金黄色葡萄球菌为例, Staphylococcus aureus 细胞壁构成:一连续层,厚20-80nm 两部分:网状骨架:微纤丝组成 基质:骨架埋于基质中 化学组成:主要是肽聚糖和磷壁酸 肽聚糖 peptidoglycan(粘肽、胞壁质) 大分子复合体,许多亚单位交联而成。 亚单位 1)双糖单位:N-乙酰胞壁酸(NAM)和N-乙酰葡萄糖胺(NAG)通过a-1,4糖苷键相 连而成
细菌大小也不是一成不变的。 细胞重量 10-13-10-12g ,每 g 细菌含 1-10 万亿个细菌。 二、细菌细胞结构 研究细菌细胞结构是分子生物学重要内容之一,有了电子显微镜才有可能。 其结构分为基本结构和特殊结构。 基本结构是细胞不变部分,每个细胞都有,如细胞壁、膜、核。 特殊结构是细胞可变部分,不是每个都有,如鞭毛、荚膜、芽孢。 (一)基本结构 1、细胞壁 cell wall:位于细胞表面,较坚硬,略具弹性结构。 功能:1)维持细胞外形;2)保护细胞免受机械损伤和渗透压危害;3)鞭毛运动支点; 4)正常细胞分裂必需;5)一定的屏障作用;6)噬菌体受体位点所在。另外与细菌的抗 原性、致病性有关。 革兰氏染色 Cristein Gram,1884 发明(Koch 实验室) 染色过程:(插入) 凡是不能被乙醇脱色,呈蓝紫色,称为革兰氏阳性菌 G+ 凡是经乙醇脱色,呈复染剂颜色,称为革兰氏阴性菌 G- 结果不同主要是细胞壁组成及结构差异造成的。 (1)革兰氏阳性菌 Gram positive 以金黄色葡萄球菌为例,Staphylococcus aureus 细胞壁构成:一连续层,厚 20-80nm 两部分:网状骨架:微纤丝组成 基质:骨架埋于基质中 化学组成:主要是肽聚糖和磷壁酸 肽聚糖 peptidoglycan (粘肽、胞壁质) 大分子复合体,许多亚单位交联而成。 亚单位 1)双糖单位:N-乙酰胞壁酸(NAM)和 N-乙酰葡萄糖胺(NAG)通过 â-1,4 糖苷键相 连而成