基因 基因组物理图 组测 全基因组鸟 基于克隆物理 枪法测序 图的测序 序的 策略 二 由上至 下(左 和由下 至上的 A b C 测序(右) 全基因组鸟枪法测序和基于克隆物理图的测序都必 须要有高密度的分子标记
基因 组测 序的 策略 --- 由上至 下(左) 和由下 至上的 测序(右) 全基因组鸟枪法测序和基于克隆物理图的测序都必 须要有高密度的分子标记
为何要用分子标记进行 基因组作图 基因组测序的基本策略是将整个基因组分 割成一些小的片段分别测序,然后将测序的 片段进行组装,使其回归到原来的位置 为了确保分散的基因片段正确归位组装,必 须寻找一批标记,它们在染色体上的位置是 已知的、唯一的、确定的,并位于不同的测 序片段之中
为何要用分子标记进行 基因组作图 基因组测序的基本策略是将整个基因组分 割成一些小的片段分别测序, 然后将测序的 片段进行组装, 使其回归到原来的位置. 为了确保分散的基因片段正确归位组装, 必 须寻找一批标记,它们在染色体上的位置是 已知的、唯一的、确定的, 并位于不同的测 序片段之中
基因组路标( endmarker 染色体上的基因和DNA顺序 标记1 均可作为路标,路标具有 物理属性,它们由特定的 标记2DNA顺序组成.路标位于 染色体上的位置是固定的 唯一的,不会更改的,因而 标记3提供了作图的依据
基因组路标(landmarker) 标记1 标记2 标记3 染色体上的基因和DNA顺序 均可作为路标, 路标具有 物理属性,它们由特定的 DNA顺序组成. 路标位于 染色体上的位置是固定的, 唯一的,不会更改的,因而 提供了作图的依据
座位(cus)与位点(sie) Locus:座位是经典遗传学中常用的概念,系指染 色体上经遗传分析确定的某个位置,它们 可以是基因、DNA顺序或分子标记.因此 locus系指遗传单元在染色体所占据的位置 Site:位点是指基因组物理图上某一确定的DNA 顺序 注:当 locus是指确定的DNA顺序或基因序列时, 也可称为site
座位(locus)与位点(site) Locus: 座位是经典遗传学中常用的概念, 系指染 色体上经遗传分析确定的某个位置, 它们 可以是基因、DNA顺序或分子标记. 因此 locus系指遗传单元在染色体所占据的位置. Site: 位点是指基因组物理图上某一确定的DNA 顺序. 注: 当locus是指确定的DNA顺序或基因序列时, 也可称为site
遗传作图标记 1)第一代分子标记,单一顺序多态性: RFLP. AFLP. RAPD 2)第二代分子标记,重复顺序多态性 Simple sequence length polymorphisrns, SSLPs Variable number of tandem repeats, VNTR Simple tandem repeats, STR Single sequence repeats, SSR 3)第三代分子标记,单核苷酸多态性 Single nucleotide polymorphisms, SNP
遗传作图标记 1) 第一代分子标记,单一顺序多态性: RFLP, AFLP, RAPD 2) 第二代分子标记, 重复顺序多态性: Simple sequence length polymorphisrns, SSLPs Variable number of tandem repeats, VNTR Simple tandem repeats, STR Single sequence repeats, SSR 3) 第三代分子标记, 单核苷酸多态性: Single nucleotide polymorphisms, SNP