第2章遗传图绘制
第2章 遗传图绘制
结构基因组的研究策略 基因组的测序路线 作图测序组装 遗传图物理图图譜测序随机测序骨架图空隙填补 整合 校正 草图与精图
结构基因组的研究策略
为何要绘制遗传图与物理图? 1)基因组太大,必需分散测序,然后将分 散的顺序按原来位置组装,需要图譜 进行指导 2)基因组存在大量重复顺序,会干扰排序, 因此要高密度基因组图 3)遗传图和物理图各有优缺点,必须相互 整合校正
为何要绘制遗传图与物理图？ 1)基因组太大,必需分散测序,然后将分 散的顺序按原来位置组装,需要图譜 进行指导. 2)基因组存在大量重复顺序,会干扰排序, 因此要高密度基因组图. 3)遗传图和物理图各有优缺点,必须相互 整合校正
什么是遗传图? 遗传图( Genetic Map): 通过遗传学方法,以遗传图距(cM)为单位绘 制的染色体上基因或标记之间相对位置的 连锁图
什么是遗传图? 遗传图(Genetic Map): 通过遗传学方法, 以遗传图距(cM) 为单位绘 制的染色体上基因或标记之间相对位置的 连锁图
遗传图与物理图 1)遗传作图( Genetic mapping)采用遗传学 分析方法将基因或其它DNA顺序标定在染色体 上构建连锁图。这一方法包括杂交实验,家系分 析。遗传图距单位为厘摩(cM,每单位厘摩定义 为1%交换率。 2)物理作图( Physical mapping)采用分子生 物学技术直接将DNA分子标记、基因或克隆标 定在基因组实际位置。物理图的距离依作图方法 而异,如辐射杂种( radiation hybrid)作图的计 算单位为厘镭(cR,限制性片段作图与克隆作图 的图距为DNA的分子长度,即碱基对(bp,kb)
遗传图与物理图 1）遗传作图（Genetic mapping） 采用遗传学 分析方法将基因或其它DNA顺序标定在染色体 上构建连锁图。这一方法包括杂交实验，家系分 析。遗传图距单位为厘摩(cM), 每单位厘摩定义 为1%交换率。 2）物理作图（Physical mapping） 采用分子生 物学技术直接将DNA分子标记、基因或克隆标 定在基因组实际位置。物理图的距离依作图方法 而异，如辐射杂种（radiation hybrid）作图的计 算单位为厘镭(cR), 限制性片段作图与克隆作图 的图距为DNA的分子长度，即碱基对(bp, kb)