基因标记的缺点 高等生物,如 脊椎动物和显花植物等,可 用作标记的基因十分有限,许多性状都涉及 多基因; 高等生物基因组中存在大量的基因间隔区, 纯粹用基因作为标记将在遗传图谱中留下大 片的无标记区段; 只有部分基因其等位基因成员可以通过常规 试验予以区分,因而产生的遗传图是不完整 的,必需寻找其他有效的标记;
基因标记的缺点 高等生物,如 脊椎动物和显花植物等,可 用作标记的基因十分有限,许多性状都涉及 多基因; 高等生物基因组中存在大量的基因间隔区, 纯粹用基因作为标记将在遗传图谱中留下大 片的无标记区段; 只有部分基因其等位基因成员可以通过常规 试验予以区分,因而产生的遗传图是不完整 的,必需寻找其他有效的标记;
2. DNA分子标记 2.1 DNA 分子标记作图的优点: 不以表型为参照 直接检测个体基因型组成 具有共显性的特点
2. DNA分子标记 2.1 DNA 分子标记作图的优点: 不以表型为参照 直接检测个体基因型组成 具有共显性的特点
2.2 分子标记用于基因定位的发展史 基因定位最早采用的方法就是连锁分析。 通过基因与DNA标记之间的重组率来估计基因 的位置。可用于连锁分析的DNA标志是基因定 位的基础,DNA标记越多,杂合性越强,基因 定位就越方便。DNA标记的选择经历了从 RFLP-STR-SNP等发展过程。 PIC(polymorphic formation content):某一标记 在群体中出现多态性的频率
2.2 分子标记用于基因定位的发展史 基因定位最早采用的方法就是连锁分析。 通过基因与DNA标记之间的重组率来估计基因 的位置。可用于连锁分析的DNA标志是基因定 位的基础,DNA标记越多,杂合性越强,基因 定位就越方便。DNA标记的选择经历了从 RFLP-STR-SNP等发展过程。 PIC(polymorphic formation content):某一标记 在群体中出现多态性的频率
183个RFLP, 多态性不够高,杂合性(PIC)平均达 到 0 .3而且在染色体上分布不均匀,难以将一些罕 见的基因进行定位;对多基因病的定位也难以奏效, STR位点已经达到8000个,平均100kb-200kb有 一个 STR位点,杂合性(PIC)平均达到0 .7, 这已经使得连锁分析的功能发挥到了极限。 SNP位点已经达到数十万个,平均 1000bp有 一个 ,估计1700万个(40个人筛选结果)。 (短串联重复序列,STRs ,short tendem repeats)
183个RFLP, 多态性不够高,杂合性(PIC)平均达 到 0 .3而且在染色体上分布不均匀,难以将一些罕 见的基因进行定位;对多基因病的定位也难以奏效, STR位点已经达到8000个,平均100kb-200kb有 一个 STR位点,杂合性(PIC)平均达到0 .7, 这已经使得连锁分析的功能发挥到了极限。 SNP位点已经达到数十万个,平均 1000bp有 一个 ,估计1700万个(40个人筛选结果)。 (短串联重复序列,STRs ,short tendem repeats)
2.3 分子标记 ▪ RFLP(restriction fragment length polymorphisms,限制性片段长度多态性)
2.3 分子标记 ▪ RFLP(restriction fragment length polymorphisms,限制性片段长度多态性)