P2 100bp4300bg Mbo酶切位点 个体IF一200bp 350bp 5 GATC GATC -- GATC --3 5′--GATC------GATC- --GATC--3′ 个体II 200b 350bp 5--GATC------GATC----------------GATC--3 550bp gatc GTTC - - GATC --3 突变导致了一个酶切位点的丢失 用Mbo酶切由引物P1和 引物P2扩增的PCR产物 400bp 300bp 100bp 个体I 个体II 图7-4 PCR-RFLP
图 7 -4 PCR —RFLP 11
二)串联重复序列标记( tandem repeated sequence, TRS) ○真核基因组序列 单一序列 短片段重复序列(正向重复、反向重复、回文序列) 长片段重复序列(轻度重复、中度重复、高度重复)
12 （二）串联重复序列标记（tandem repeated sequence,TRS） ○ 真核基因组序列 单一序列 短片段重复序列（正向重复、反向重复、回文序列） 长片段重复序列（轻度重复、中度重复、高度重复）
高度重复序列 卫星DNA( satellite DNA)序列中G(含量约30%, 远低于基因组中主体DNA(GC含量约42%)。将DNA切 成片段进行氯化铯密度梯度离心时,由于富含AT浮力密度 小,形成一条窄带在主体DNA外面,故称卫星DNA。 小卫星DNA( minisatellite dna) 微卫星DNA( microsatellite dna)
13 高度重复序列 卫星DNA（satellite DNA） 序列中G-C含量约30%， 远低于基因组中主体DNA （G-C含量约42%）。将DNA切 成片段进行氯化铯密度梯度离心时，由于富含A-T浮力密度 小，形成一条窄带在主体DNA外面，故称卫星DNA。 小卫星DNA（minisatellite DNA） 微卫星DNA（microsatellite DNA）
主带卫星带 1.7011.690 官米 2x:12 浮力密度 图7-6卫星DNA
图 7 -6 卫星DNA 14
O小卫星标记 小卫星DNA是一种可变数量的串联重复( varible number of tandem repeats,VNTR),在不同个体和基因组 的不同位点上数目都不同 用内切酶把总DNA切成不同长度的片段(VNTR上没 有酶切位点),再以VNTR中的特殊序列为探针进行 Southern杂交,由于不同个体的这种串联重复的数目及位置 不同,所以ⅤNTR的 Southern杂交谱带具有高度的个体特异 性,故又称其为DNA指纹( DNA fingerprints)
15 ○小卫星标记 小卫星DNA是一种可变数量的串联重复（varible number of tandem repeats, VNTR），在不同个体和基因组 的不同位点上数目都不同。 用内切酶把总DNA切成不同长度的片段（VNTR上没 有酶切位点），再以VNTR中的特殊序列为探针进行 Southern杂交，由于不同个体的这种串联重复的数目及位置 不同，所以VNTR的Southern杂交谱带具有高度的个体特异 性，故又称其为DNA指纹（DNA fingerprints）