流行规律的研究（一）（1）传播范围的确定·按照传染病流行病学基本理论，在一次爆发或流行中，其受染范围的确定应根据如下原则：在爆发或流行期间，有共同或有效暴露史，经过一个平均潜伏期发病或出现急性感染的生物学标志可判定为受染者，然后总计受染人员，结合这些人员活动的区域以确定受染或流行涉及范围·可是，过去测定的生物学标志主要是属于血清学、免疫学、微生物学范围，缺之基因型标志，因而可能出现错误的判断。分子流行病学研究缩小了常规流行病学调查所推测受染范围从基因水平上证实爆发的受染人数与传染来源
（1）传播范围的确定 按照传染病流行病学基本理论，在一次爆发或流行中，其受染 范围的确定应根据如下原则：在爆发或流行期间，有共同或有效 暴露史，经过一个平均潜伏期发病或出现急性感染的生物学标志 可判定为受染者，然后总计受染人员，结合这些人员活动的区域， 以确定受染或流行涉及范围。 可是，过去测定的生物学标志主要是属于血清学、免疫学、微 生物学范围，缺乏基因型标志，因而可能出现错误的判断。 分子流行病学研究缩小了常规流行病学调查所推测受染范围， 从基因水平上证实爆发的受染人数与传染来源。 流行规律的研究（一）
小流行规律的研究（二）（2）传播途径的判定近来分子流行病学研究引入一些新的技术，如分子进化诊断(molecular evolutionary diagnosis)。案例：1990年7月，美国佛罗里达州一名AIDS妇女，怀疑在当地一牙科诊所手术时感染了HIV，因为该诊所的牙科医生也是一名AIDS患者。随后当地卫生部门对该牙医诊治过的一于余名患者进行HV检测，共发现7名HIV感染者有在该诊所的就诊史。那么这7名HIV感染者是否与该牙医有关呢？
（2）传播途径的判定 近来分子流行病学研究引入一些新的技术 ，如 分子进化诊断 （molecular evolutionary diagnosis）。 案例：1990年7月，美国佛罗里达州一名AIDS妇女，怀疑在当地一牙 科诊所手术时感染了HIV，因为该诊所的牙科医生也是一名AIDS患者。 随后当地卫生部门对该牙医诊治过的一千余名患者进行HIV检测，共 发现7名HIV感染者有在该诊所的就诊史。 •那么这7名HIV感染者是否与该牙医有关呢？ 流行规律的研究（二）
针对这一问题可采取的分析方法：1、传统流行病学分析方法：接触者调查，分析感染者可能的危险行为如输血、静脉吸毒、不洁性交史等。2、分子流行病学方法：比较HIV病毒基因序列的差异，分析不同病例感染株遗传关系的远近
针对这一问题可采取的分析方法： 1、传统流行病学分析方法：接触者调查，分析感染 者可能的危险行为如输血、静脉吸毒、不洁性交史等。 2、分子流行病学方法：比较HIV病毒基因序列的差 异，分析不同病例感染株遗传关系的远近
与对照感染株的遗与牙医感染株的遗传变异性比较传变异性比较KnownM13IntrapersonInterpersonvariationt(%)PersonSexriskClinical status*clonesvariationtfactor(%)To(no.)To30LCstdentistDentistMYesAIDS611.0 (5.816.0)3.3 (0.8-5.4)FPatientANoAIDS63.410.9(5.4-14.8)2.0 (0.0-4.5)(0.8-6.2)FPatientBNo12Asymptomatic1.9 (0.4-3.7)4.4(2.1-7.0)11.2(6.2-16.5)(CD4=222/μl)5PatientCMNos3.411.1 (7.0-15.6)1.2 (0.41.6)(2.14.9)Asymptomatic(CD4=<50/μl)FPatientENo63.4Asymptomatic2.1 (0.4-3.7)(1.2-6.6)10.8(5.8-14.8)(CD4567/μl)5MPatientGNo4.9Asymptomatic2.8 (1.6-3.7)(2.9-7.0)11.8(6.2-16.9)(CD4=400/μl)5Patient DMAIDSYes13.6(11.5-15.6)7.5(0.0-9.9)13.1(7.8-17.3)M6PatientFYesAsymptomatic3.0 (0.85.8)10.711.9(7.0-17.3)(8.213.6)(CD4 =253/μl)
与牙医感染株的遗 传变异性比较 与对照感染株的遗 传变异性比较
ADentist-x进化树分析Dentist-y牙医及病人PatientC-xPatient C-yA.B.C,E,G·Patient A-yPatientG-xPatient G-yPatient A-x..PatientB-xPatient B-yPatient E-xPatient E-yLC2-X当地对照LC3-XLC2-yPatient F-xPatientF-y病人FLcConsensus SequenceLC9LC35LC3-y病人D4%PatientD-xPatient D-y
病人D 当地对照 牙医及病人 A,B,C,E,G 病人F 进化树分析