获得/丢失的机制 iRNA结合区域 同源基因 3对 67对 核苷酸突变在获得丢失mN结合位点进化过程中扮演 着重要角色 浙江大学生命科学学院 洲江学博士学位论文答辩
获得/丢失的机制 浙江大学生命科学学院 11 13对 核苷酸突变在获得/丢失miRNA结合位点进化过程中扮演 着重要角色 同源基因 miRNA结合区域 67对
MiRNA结合位点的序列替代率 Dataset Regions K P Ka Total 5 flanking1.228±0.0931.387e00.189±0.0161.824e04 Binding site 0.573+0.082/ 0.125±0026/ 3 flanking1.424±0.0929.46e8 0.186±0.0171.259e03 表2195个基因组倍增基因的 miRNA结合位点和它们两端区域的同义替代率与非同义替代 率的估算 群体遗传学数据 浙江大学生命科学学院 洲江学博士学位论文答辩
miRNA结合位点的序列替代率 浙江大学生命科学学院 12 Dataset Regions Ks P Ka P Total 5flanking 1.228±0.093 1.387e -06 0.189±0.016 1.824e -04 Binding site 0.573±0.082 / 0.125±0.026 / 3flanking 1.424±0.092 9.46e -08 0.186±0.017 1.259e -03 表 2.1 95个基因组倍增基因的miRNA结合位点和它们两端区域的同义替代率与非同义替代 率的估算。 群体遗传学数据
mirna结合位点的核苷酸分歧度 mirNA Target genen Region Position Length(bp) S (×10-3)0(×10-3) 5 flanking 1-197 5.75 646 mr156 Os3989029 Binding site 198-218 21 0 3 flanking_219797279 2.02 2.93 5 flanking 1-455 0.15 0.56 Os5966029 Binding site 456-476 21 3 nanking 477-778 302 2.09 5 flanking 1-212 212 2.53 mr390 Os10100 Binding site 213-233 3 flanking_234-689456 1.04 1.14 5' flanking 1-36 2.38 765 Os0993024 Binding site 37-57 3 flanking_58-793736 far nking 1- 27 m408 Os1534025 28-49 22 0 3 flanking_ 50-646 0.56044 5 hankin 40 0 m820 Os02010 Binding site 41-61 3 flanking 62-610 1.79 0.98 5' nanking 161.2 1.5 1.80 2.85 Binding site 0 536.5 表22栽培稻群体中6个被实验证实的 mirNA结合位点序列分歧度。 浙江大学生命科学学院 洲江学博士学位论文答辩
miRNA结合位点的核苷酸分歧度 浙江大学生命科学学院 13 miRNA Target gene n Region Position Length (bp) S (×10-3 ) θ (×10-3 ) 5' flanking 1-197 197 5 5.75 6.46 mir156 Os39890 29 Binding site 198-218 21 0 0 0 3' flanking 219-797 279 6 2.02 2.93 5' flanking 1-455 455 1 0.15 0.56 mir159 Os59660 29 Binding site 456-476 21 0 0 0 3' flanking 477-778 302 3 2.09 2.54 5' flanking 1-212 212 2 2.53 2.45 mir390 Os10100 27 Binding site 213-233 21 0 0 0 3' flanking 234-689 456 2 1.04 1.14 5' flanking 1-36 36 1 2.38 7.65 mir395 Os09930 24 Binding site 37-57 21 0 0 0 3' flanking 58-793 736 4 1.66 1.47 5' flanking 1-27 27 0 0 0 mir408 Os15340 25 Binding site 28-49 22 0 0 0 3' flanking 50-646 597 1 0.56 0.44 5' flanking 1-40 40 0 0 0 mir820 Os02010 24 Binding site 41-61 21 0 0 0 3' flanking 62-610 549 2 1.79 0.98 5' flanking / 161.2 1.5 1.80 2.85 Average Binding site / 21.2 0 0 0 3' flanking / 536.5 3.0 1.53 1.58 表2.2 栽培稻群体中6个被实验证实的miRNA结合位点序列分歧度