基因分类 1.ORF1ab:编码PP1ab和PP1a两种多蛋白，多蛋白可切割成多种非结构蛋白。例如，SARS- CoV-2非结构蛋白负责病毒转录、复制、蛋白酶处理、宿主免疫反应抑制和宿主基因表达 抑制。RNA依赖RNA聚合酶是抗病毒疗法的目标。 2.S:编码表面糖蛋白（结构蛋白，也叫尖峰蛋白）。这种糖蛋白调解病毒粒子的附着和 进入宿主细胞。S蛋白是疫苗开发、抗体疗法和诊断抗原检测的重要靶点。 3.ORF3a:编码一种具有离子通道活性（维罗戈林）的蛋白质，能够激活NLRP3炎症体（炎 性小体的一种，能够识别病原相关分子模式或者宿主来源的危险信号分子，招募和激活促 炎症蛋白酶Caspase--1)。ORF3a也可能在病毒复制和发病机制中发挥作用
基因分类 1.ORF1ab：编码PP1ab和PP1a两种多蛋白，多蛋白可切割成多种非结构蛋白。例如，SARSCoV-2非结构蛋白负责病毒转录、复制、蛋白酶处理、宿主免疫反应抑制和宿主基因表达 抑制。RNA依赖RNA聚合酶是抗病毒疗法的目标。 2.S：编码表面糖蛋白（结构蛋白，也叫尖峰蛋白）。这种糖蛋白调解病毒粒子的附着和 进入宿主细胞。S蛋白是疫苗开发、抗体疗法和诊断抗原检测的重要靶点。 3.ORF3a：编码一种具有离子通道活性（维罗戈林）的蛋白质，能够激活NLRP3炎症体（炎 性小体的一种，能够识别病原相关分子模式或者宿主来源的危险信号分子，招募和激活促 炎症蛋白酶Caspase-1）。ORF3a 也可能在病毒复制和发病机制中发挥作用
4.E:编码包络蛋白，存在于病毒颗粒中。这种蛋白质有助于病毒的组装和释放，并且具有发病机制所 需的离子通道活性。 5.M:编码膜糖蛋白，是一种跨膜糖蛋白，是病毒颗粒中最丰富的结构蛋白，已被推荐为抗病毒药物 靶点。 6.0RF6a:编码0RF6a蛋白，基于它与其他冠状病毒蛋白的相似性，0RF6蛋白被认为在病毒发病机制中 发挥作用。 7.ORF7a:编码0RF7a蛋白，基于它与其他冠状病毒蛋白的相似性，ORF7a蛋白被认为是一种第一型跨 膜蛋白
4.E:编码包络蛋白，存在于病毒颗粒中。这种蛋白质有助于病毒的组装和释放，并且具有发病机制所 需的离子通道活性。 5.M：编码膜糖蛋白，是一种跨膜糖蛋白，是病毒颗粒中最丰富的结构蛋白，已被推荐为抗病毒药物 靶点。 6.ORF6a：编码ORF6a蛋白，基于它与其他冠状病毒蛋白的相似性，ORF6蛋白被认为在病毒发病机制中 发挥作用。 7.ORF7a：编码ORF7a蛋白，基于它与其他冠状病毒蛋白的相似性，ORF7a蛋白被认为是一种第一型跨 膜蛋白
8.ORF7b:编码0RF7b蛋白，基于与其他冠状病毒的相似性，被认为集中在高 尔基体上 9.0RF8:编码蛋白功能未知 10.N:编码核衣壳磷蛋白，是一种结构蛋白，与病毒RNA基因组结合，保护 病毒RNA基因组，并参与将RNA包装成病毒颗粒。N蛋白已被建议作为抗病毒 药物靶点。 11.0RF10:编码功能未知
8.ORF7b：编码ORF7b蛋白，基于与其他冠状病毒的相似性，被认为集中在高 尔基体上 9.ORF8：编码蛋白功能未知 10.N：编码核衣壳磷蛋白，是一种结构蛋白，与病毒RNA基因组结合，保护 病毒RNA基因组，并参与将RNA包装成病毒颗粒。N蛋白已被建议作为抗病毒 药物靶点。 11.ORF10：编码功能未知
序列分析 此前已知10个亚基因组RNA构成病毒颗粒结构。然而，研究小组证实了9个亚基因组RNA 的存在，而剩下的一个亚基因组RNA是无效的。研究人员还发现，由于RNA融合和缺失事件 ,存在数十种未知的亚基因组RNA。“尽管需要进一步研究，但这些分子事件可能导致冠状 病毒相对快速的进化。此外，我们发现病毒RNA有多种未知的化学修饰。目前尚不清楚这些 修改的作用，但有一种可能性是，它们可能有助于病毒避免来自宿主的攻击。” 5000 10000 15000 20000 25000 29903 0 10 2025 26 27 28 29 30 ORF1a ORF1b 3'UTR gRNA i▣ ■■A从 S TRS-L RNA TRS-B TRS-B 3a D E■ 3■ M■ E n 6■ A二AA 6 Modification level (% 7b 7 0 1020304060 80 8 100■
序列分析 此前已知10个亚基因组RNA构成病毒颗粒结构。然而，研究小组证实了9个亚基因组RNA 的存在，而剩下的一个亚基因组RNA是无效的。研究人员还发现，由于RNA融合和缺失事件 ，存在数十种未知的亚基因组RNA。“尽管需要进一步研究，但这些分子事件可能导致冠状 病毒相对快速的进化。此外，我们发现病毒RNA有多种未知的化学修饰。目前尚不清楚这些 修改的作用，但有一种可能性是，它们可能有助于病毒避免来自宿主的攻击
Start of genome 30,000 RNA letters THE SARS-CoV-2 GENOME ORF1ab PROTEIN STRUCTURAL PROTEINS 0 Spike EMN NON-STRUCTURAL ACCESSORY PROTEINS(NSPs) PROTEINS 3 57911 13 15 3a 67b9b 10 4681012 14 16 3b 7a 8 9c